芯片与生物信息学

Pathway富集分析-基因芯片数据信号转导分析服务

基本信息
服务名称:
Pathway富集分析-基因芯片数据信号转导分析服务
英文名称:
Pathway Enrichment Analysis
参考报价:
3250
总点击数:
5117
更新日期:
2011-12-23
服务类别:

服务详情

Pathway富集分析(Pathway Enrichment):

分析内容对差异基因(P<0.05 或P<0.01)进行信号转导通路分析:


a.提供差异基因(P<0.05或P<0.01)基因的所有信号通路(Pathway);

 

b. 富集分析前10个最重要信号转导通路(Pathway),并提供信号转导通路图。

 

c. 信号转导通路富集分析图(热图Heatmap+聚类Cluster)

 

信号转导通路富集分析

 

KEGG信号转导通路

 

 

 

 

Pathway富集分析可以归纳总结出芯片实验数据的结果,显示出某一生理过程所采用的信号传递途径。

 

通过差异基因的Pathway 分析,可以找到不同样品间差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。通过芯片结果得到的是编码这些蛋白质的mRNA 表达量的变化;从mRNA 到蛋白表达还要经过microRNA 调控,翻译调控,翻译后修饰(如糖基化,磷酸化),蛋白运输等一系列的调控过程,mRNA 表达量和蛋白表达量之间往往不具有线性关系,因此mRNA 的改变不一定意味着蛋白表达量的改变。但Pathway富集分析的结果却可以提示研究者蛋白的活性和表达量的变化。这为后期的蛋白活性验证和蛋白表达量验证均有不可估量的预示作用。在某些pathway 中,如EGFR/ERBB 通路,细胞可以在维持蛋白量不变的情况下,通过蛋白磷酸化程度的改变(调节蛋白的活性)来调节这条通路。所以芯片数据pathway 分析的结果需要有后期蛋白质功能实验的进一步验证,如采用流式细胞检测细胞抗原、Western blot蛋白半定量检测、Elisa激酶活性检测,免疫组化(IHC),RNAi(RNA 干扰,miRNA)等技术手段做进一步深入的研究。

 


 

联系邮箱Email:bpsbiopharm@sina.com 

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拜珐(上海)信息技术有限公司

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公司简介

公司简介:

拜珐(上海)信息技术有限公司是一家致力于生物医学、药学、高通量芯片技术、临床前药物开发、分子诊断、个性化治疗,生物检测试剂研发等科研领域的新兴高科技技术公司,总部位于美国亚利桑那州(Arizona –AZ) 。其产品BioPharm生物医药系统(BioPharm Information System)是公司自主研发的应用于药物筛选,生命科学研究,芯片数据分析,疾病机制研究的直观的科研系统。系统内不但有拥有自主知识产权的专业数据库,也有来源于文献资料的可靠的医药学专业信息;它不仅结合了NCBI,EMBL-EBI等已有生物医药数据库信息,也提供了简单易用的检索方式和丰富的检索类别。BPS是生命科学研究的必备工具之一。拥有本系统不但可以使研究者更快更轻松地获得所需的医药学关联信息,也可以极大地提高科学研究效率,把握研究领域的重点,节省宝贵的科研时间。BPS适用于靶向药物筛选,疾病和药物相关基因功能研究,生物芯片数据处理和芯片研发,实验参数查找,医学研究等。公司还致力于开发疾病诊断检测、蛋白芯片、基因芯片MicroArray、药物筛选产品和解决方案。

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