ApoE基因敲除小鼠是除LDL以外的所有脂蛋白的结构组成，在维持血脂代谢的平衡中起关键作用。ApoE功能缺失会导致胆固醇清除途径受限，胆固醇残粒在血浆中沉积。ApoE基因敲除严重高胆固醇血症小鼠是首个自发性动脉硬化基因工程小鼠模型，是目前在AS研究领域中应用最多的基因工程动物。ApoE基因敲除小鼠的血浆胆固醇浓度升高5倍，甘油三酯升高68％。浆LDL和VLDL水平显著高于正常对照组，HDL水平则低于正常小鼠。3月龄ApoE基因敲除小鼠可在临近大动脉附近发现脂肪纹，它们会对机体造成损害，并且这种损害随年龄增长及脂质减少而增加，8月龄时可见严重的冠状动脉堵塞, 17月龄以上ApoE基因敲除小鼠脑部可见晶状胆固醇裂隙和脂质滴，泡沫细胞中有黄瘤的损害，小的黄瘤在脉络丛和腹侧穹中也能看到。病变形态、位置及发展过程均与人类相似，另外在行为上，ApoE基因敲除小鼠对应激反应减弱、学习与记忆功能改变，可用于研究apoE缺失在乙酰胆碱神经损害所致认知障碍过程中发挥的作用。.

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