miRNA芯片全面解决方案
microRNAs(miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70—90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或抑制mRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达（最新发现microRNA也能在转录水平调控基因表达）。microRNA在物种进化中相当保守，在动物、植物和真菌等中发现的microRNAs表达均有严格的组织特异性和时序性。microRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用，包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。
一、技术路线和方法：
二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01：原始数据预处理与均一化
Part02：差异microRNA筛选
Part03：聚类分析（层次聚类、K-means聚类）
Part04：差异microRNA靶基因预测（或与mRNA芯片关联分析）
Part05：靶基因GO分类
Part06：靶基因Pathway分析
2.2 高级数据分析
Part08：差异microRNA转录因子结合位点分析（或与转录因子芯片关联分析）
Part09：差异microRNA与靶基因调控网络
Part10：转录因子、microRNA、靶基因互作网络
Part11：差异microRNA调解效应评分分析
三、芯片平台
| 芯片平台 （Human） |
型号 | miRNA 数量 | 规格 | 货号 |
| Agilent | Agilent Human miRNA芯片V18.0 | 1523条人miRNA | 8×60K | BT1000212 |
| 364条人病毒miRNA | ||||
| Agilent | Agilent Human miRNA芯片V16.0 | 1205条人miRNA | 8×60K | BT1000215 |
| 142条人病毒miRNA | ||||
| Affymetrix | GeneChip®miRNA3.0V17芯片 | 19931（成熟miRNA）2999（人，大小鼠前体） | 1× | BT1000211 |
| LC | µParaflo® Microfluidic Biochip Technology18.0 | 1898条 | 1× | BT1000213 |
| 华联 | 人类miRNA 芯片v4(18.0) | 1921(1884条探针) | 1× | BT1000214 |
| 芯片平台 （Mouse） |
型号 | miRNA 数量 | 规格 | 货号 |
| Agilent | Agilent Mouse miRNA芯片V18.0 | 1122条小鼠miRNA | 8×60K | BT1000222 |
| 57条小鼠病毒miRNA | ||||
| Affymetrix | GeneChip®miRNA3.0V17芯片 | 19931（成熟miRNA）2999（人，大小鼠前体） | 1× | BT1000221 |
| LC | µParaflo® Microfluidic Biochip Technology20.0 | 1908条 | 1× | BT1000223 |
| 华联 | 小鼠&大鼠miRNA 芯片v5(19.0) | 小鼠1265条 | 1×(468探针共有) | BT1000224 |
| 大鼠722条 |
| 芯片平台 （RAT） |
型号 | miRNA 数量 | 规格 | 货号 |
| Agilent | Agilent Rat miRNA芯片V18.0 | 677条 | 8×15K | BT1000232 |
| Affymetrix | GeneChip®miRNA3.0V17芯片 | 19931（成熟miRNA）2999（人，大小鼠前体） | 1× | BT1000231 |
| LC | µParaflo® Microfluidic Biochip Technology20.0 | 728条 | 1× | BT1000233 |
| 华联 | 小鼠&大鼠miRNA 芯片v5(19.0) | 小鼠1265条 | 1×(468探针共有) | BT1000234 |
| 大鼠722条 |
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