外显子组测序
采用Agilent最新的外显子捕获试剂盒(SureSelect Human All Exon 50Mb Kit)进行外显子捕获,捕获区域可达50Mb。
外显子组是指全部外显子区域的集合,该区域包含合成蛋白质所需要的重要信息,涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。与全基因组重测序相比,外显子组测序只需针对外显子区域的DNA即可,覆盖度更深、数据准确性更高,更加简便、经济、高效。可用于寻找复杂疾病如癌症、糖尿病、肥胖症的致病基因和易感基因等的研究。
外显子组测序实验流程
外显子组测序生物信息分析:
1)原始数据产出统计;
2)基因组单碱基深度及覆盖度分析;
(以上两项为基本分析)
3)序列组装;
4)SNP检测及其在基因组的分布情况统计,能够检测short indel
外显子组测序样品要求:
客户提供待测基因组样本。
1. 样品总量:每次外显子捕获需要大于10μg的样品,为保证实验质量及延续性,请一次性提供至少20μg样品;
2. 样品纯度:OD260/280值在1.8~2.0 之间;
3. 样品浓度:不低于200ng/ul;
4. 样品保存:选择酒精、TE buffer或超纯水一种,请在样品信息单中注明;
5. 样品运输:样品请置于1.5 ml管中,做好标记,使用封口膜封好,并同《样品信息单》一起放到塑料样品袋中封口。建议使用干冰或冰袋运输,并选择较快的运输方式。
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