eArray定制芯片结合测序的整合技术方案
基本信息
服务名称：
eArray定制芯片结合测序的整合技术方案
英文名称：
参考报价：
价优 电话：021-59189673
服务商：
总点击数：
1524
更新日期：
2015-06-01
服务类别：
服务详情
公司利用自身优势，结合agilent的e-array芯片设计技术，提供整合方案如下。该整合方案尤其适合于以基因组或转录组背景尚不清晰的新物种为研究对象的科研工作者。可以在尽短的时间内，快速切入新物种的功能基因研究领域，大大缩进进程，提高研究效率和质量。
整合解决方案一（转录组二代测序技术深度测序+agilent表达谱芯片定制）
1、转录组深度测序服务
样品准备：尽量选择处于生长或发育活跃期的组织部位（如根尖，叶芽，花蕾，植物的幼嫩部位等），尽量增加组织的丰富度（如不同组织类型，不同发育阶段等），以期获得丰富的RNA种类 。
RNA抽提及质量检测：分别抽提总RNA，进行质量检测，务必保证RNA的高质量（尽量去除核糖体RNA等），将不同部位的RNA等量混合，进行建库 。
深度测序。
数据分析与处理：去除建库时用的接头序列，并且根据每个碱基的quality把序列两侧的低值区域去掉；序列拼装得到contig和singlets。
2、agilent表达谱芯片定制服务
依据上述序列信息进行芯片探针设计（利用agilent的e-array探针设计软件）。
根据探针数量及客户要求进行芯片设计，确定物种基因探针、质控探针的数量与排布等。
设计方案提交agilent公司，进行芯片生产（约需2个月）。
3、表达谱芯片技术服务
协助客户根据课题要求进行芯片课题设计
客户根据课题进行样品准备
样品抽提、质量检测、放大、标记、杂交、扫描与分析
整合解决方案二（文库构建+传统测序+agilent表达谱芯片定制）
1、均一化cDNA文库构建
样品准备：尽量选择处于生长或发育活跃期的组织部位（如根尖，叶芽，花蕾，植物的幼嫩部位等），尽量增加组织的丰富度（如不同组织类型，不同发育阶段等），以期获得丰富的RNA种类。
RNA抽提及质量检测：分别抽提总RNA，进行质量检测，务必保证RNA的高质量（尽量去除核糖体RNA等），将不同部位的RNA等量混合，进行均一化cDNA文库构建。
2、3730测序及生物信息学分析
文库转化、涂板、挑克隆
3730测序
序列比对分析与功能注释，拼装获得contig和singlets
3、agilent表达谱芯片定制服务
依据上述序列信息进行芯片探针设计（利用agilent的e-array探针设计软件）。
根据探针数量及客户要求进行芯片设计，确定物种基因探针、质控探针的数量与排布等。
设计方案提交agilent公司，进行芯片生产（约需2个月）。
4、表达谱芯片技术服务
协助客户根据课题要求进行芯片课题设计
客户根据课题进行样品准备
样品抽提、质量检测、放大、标记、杂交、扫描与分析
公司简介
上海博苑蛋白质组技术服务中心是一家专注于生命科学和生物技术领域的高科技企业，主要从事以蛋白质和蛋白质组为基础的，包括基因及基因组、表型组、生物信息学分析在内的多方面的服务。公司坚持以技术创新为先导，打造一流的科技服务平台；同时公司秉承客户至上的原则，竭诚为广大科研工作者提供优质、高效的技术服务，帮助广大科研工作者在自己的研究领域创造新的成果，为生命科学的研究与发展提供强大支持。
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