分子与细胞

SNP分型服务

基本信息
服务名称:
SNP分型服务
英文名称:
Sequenom MassARRAY Genotype
参考报价:
0
总点击数:
1058
更新日期:
2013-09-02
服务类别:

服务详情

 Sequenom MassARRAY Genotype


质谱是带电原子、分子或分子碎片按分子量(质荷比)的大小顺序排列的图谱。质谱仪可通过对物质的分子量(质荷比)进行检测,达到区分、鉴别物质的目的。SNP位点两个等位基因之间存在分子量差异,通过分型实验将差异放大,然后以质谱仪进行检测即可达到SNP分型的目的。带电物质无电场的真空管(Drift region)中的飞行速度与分子量负相关,分子量越小,飞行速度越快,到达检测器(Detector)的时间越早,反之亦然。
 
图1:飞行时间质谱检测物质分子量的原理
实验原理:
MassEXTEND单碱基延伸反应,紧挨SNP位点设计一段探针,在反应体系中以ddNTP替代dNTP,使探针仅在SNP位点处延伸一个碱基即终止。根据SNP位点的不同,探针将结合不同的ddNTP,从而具有不同的分子量,质谱仪即可检测出这种分子量差异,从而实现SNP分型的目的。

 
图2:飞行时间质谱法对SNP进行分型的原理示意图
技术优势:
1)质谱仪检测的是分子最本质的特征之一——分子量,不涉及荧光标记、凝胶电泳等,就能检测一个碱基的差异,准确性高,机器本身出错的概率非常低;
2)质谱仪的灵敏度非常高,检测窗口内,任何pmol级别的物质都能被检测出来;
3)通量高:几秒就能检测完一个反应孔;
4)操作简单,仪器要求简单,除质谱仪外,都是常规PCR仪器;
5)灵活:每天可以完成几个反应至上万个反应;
6)便宜:引物不带荧光标记,普通长度(3条引物总长80bp左右),此外在一个反应孔内能完成4个或更多的反应,即通常所说的4重反应;
7)兼容性强:质谱仪还能在核酸的其它方向,以及蛋白质组学、微生物鉴定等领域也能应用。
8)质谱技术是“一管式操作”,即反应体系在生化学实验过程中始终在一个试管内反应,没有多次转移,这样就减少被污染的概率。
服务路线:
 
位点选择(a、客户提供 b、公司技术设计)
 
引物设计(Sequenom Assay design软件设计,最终确定检测位点)
 
样本提供(a、全血或组织 b、DNA样本,浓度10-20ng/ul,体积20ul左右)
 
Sequenom质谱检测
 
 
数据分析(关联差异分析、单倍体型分析等)
 
实验周期在2-3周以内即可全部完成。
 
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北京海淀区清华东路东王庄39号院
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公司简介

       北京信科奥达科技有限公司,成立于2007年,一直以代理实验室设备和耗材为主营业务。近年来逐步转型为生产型企业。从产品设计、制造、包装、质量管理等各环节,都采取有效的规划和管理。耗材类产品由台湾工厂制造,PCR相关耗材采用高透光认证塑料,符合美国U.S.P.CLASS VI标准。旨在为广大科研客户提供质优价廉、符合实验要求的好工具。


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