测序/合成

高通量测序/基因组测序/全转录组测序服务

基本信息
服务名称:
高通量测序/基因组测序/全转录组测序服务
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14429
更新日期:
2024-05-17
服务类别:

服务详情
高通量测序
高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。高通量测序是DNA测序发展历程的一个里程碑,可一次对几十万到几百万条 DNA 分子进行序列测定,因其具有可对完全序列未知的样本进行直接测序的特点,使得研究者对一个物种的转录组和基因组进行细致全面的分析成为可能,所以又被称为深度测序 (deep sequencing) 。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch GS FLX sequencer),Illumina公司的Solexa基因组分析仪(Illumina Genome Analyzer)和ABI的SOLiD测序仪(ABI SOLiD sequencer)。
 
随着高通量测序技术的迅猛发展,NGS技术开始越来越多地被应用来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序(whole transcriptome resequencing),从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性(cSNP)等研究;或者进行小分子RNA测序(small RNA sequencing),通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀(ChIP)和甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)技术相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。
 
一、威斯腾测序平台:
基于创新的 Illumina 的 Hiseq2000 、 Genome AnalyzerIIx 与 Roche 454 的高通量测序平台,威斯腾生物可帮助您对样本的 microRNA 、 mRNA 、 ncRNA 或 DNA 在进行各种预处理 ( 片段化与建库 ) 后进行高通量的测序。根据样本 RNA 或者 DNA 的不同应用可分为转录组测序、 microRNA测序、 ncRNA测序、基因组测序等。
 
图 1 Illumina Hiseq2000
 
 
图2 Roche GS Junior System
 
 
二、服务种类:
1、基因组测序
1)人类基因组重测序
2)动植物基因组测序(de novo)及重测序
3)细菌基因组测序(de novo)及重测序
4)真菌基因组测序(de novo)及重测序
2、转录组测序
1)真核转录组
2)细菌转录组
3)数字表达谱分析
4)MicroRNA测序
5)降解组测序分析
3、转录因子结合位点的检测
4、特定区域测序
5、目标序列捕获测序
6ChIP-seq 测序服务 
7、甲基化测序
三、服务内容:
1、基因组测序:
全新物种基因组测序:对全新的微生物、植物或动物物种基因组进行整体揭示,包括片段测序、序列组装、基因预测与注释等环节,可以从整体水平对目标物种进行研究。 
基因组重测序:全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行测序,并在个体或群体水平进行差异分析的方法。如微生物的不同菌株、不同疾病患者、不同表型个体等的基因组测定及与已有标准基因组进行比较分析。
2、转录组测序:
特定组织或者细胞中的 mRNA 经分离后制备成片段化的 cDNA 文库,通过 Illimina 测序仪对 cDNA 文库高通量测序,从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息,用于寻找差异表达基因与可能的新的可变剪接形式。
3、microRNA 与 ncRNA 测序 :
可对细胞或者组织中的全部 Small RNA 或 Noncoding RNA 进行深度测序及定量分析。用于作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、表达谱分析、miRNA 或 ncRNA 聚类等科学应用。

四、实验步骤及品控
1、实验步骤(以基因组测序为例):
实验方案确定
基因组DNA的随机打断
DNA片段的末端修复
 
修饰,末端加上接头(adapter)
PCR扩增连上接头的DNA片段
文库检测
DNA的成簇扩增
上机测序
生物信息组装/分析
2、品质保证: 
1)全程采用 Illumina 或 Roche 标准试剂; 
2)严格各环节质控,包括 RNA 电泳、基于 Nanodrop 与 Angilent Bioanalyzer 的 RNA 分析、库指标、测序数据质量等 
3)按客户需求严格保证数据总量与质量,并配以完备的数据分析服务。 

五、样品要求:
1、动物、植物、微生物组织:
    提供足量的新鲜柔嫩部位样品;新鲜程度要求:采样后将样品立即液氮速冻-80℃保存(保存期不超过1个月),干冰运输,样本保存期间切忌反复冻融。
2、RNA样品
 总RNA>500ug,浓度>1ug/ul;
 mRNA>3ug,浓度>50ng/ul;
 OD260/OD280为1.8-2.0;
3、DNA样品
OD260/280为1.8-2.0之间;样品浓度越高越好,最好不应低于30ng/ul,总量不低于20ug;基因组需保证完整,无明显降解。
 
六、结果提交:
1、原始数据报告,包含所有测序序列的序列信息,碱基读取质量评估。
2、基本数据分析报告(Excel表格),包含有效序列的序列信息
3、高级数据分析(应客户要求定制)
 1)基因组组装:包括原始数据统计、覆盖度计算、组装结果相关统计;
 2)基因组组分分析:编码基因预测,以及基因功能预测;
    3)比较基因组分析:以客户提供的近源物种的序列为参考序列,进行SNP分析、共线性分析。
 
图3:第二代测序工作流程图
 
 
 
图4:沙门氏菌 SL1344 基因组注释简图

 

公司简介

  公司简介

重庆威斯腾生物医药科技有限责任公司(简称“威斯腾生物”)是重庆高圣医药有限责任公司参与组建,放眼于全球生物医药前沿技术转化应用开发,立足于全国生物医药研发检测合作及项目孵化、成果转化,现在发展为一家集生物医药技术转化、分子诊断产品开发及创新生物药物开发的科技集团公司。威斯腾生物致力于重大疾病包括恶性肿瘤、重大传染病等领域的早期筛查及快速检测。公司总部设立于重庆高新区,同时在上海和北京设有管理团队和运行机构。 
威斯腾生物拥有专家顾问团队千人专家7人,长江学者2人,海外院士2人;现有固定研发人员100余人同时还拥有320人的海外科研顾问团队。拥有完善的基础实验平台、先进的实验设备、专业的技术团队、标准的操作流程、优质的合作平台和强大的科学家网络,可为国内外研发机构与药企提供专业的生物研发检测合作和科技成果转化项目指导。七大基础服务平台包括:细胞生物学研究平台、分子生物学研究平台、病理学研究平台、免疫学研究平台、动物模型研究平台、蛋白质与多肽研究平台、测序和芯片研究平台。此外,公司拥有四大创新研发中心:分子诊断开发平台,CRISPR/Cas9靶向基因修饰药物开发平台、纳米靶向载药创新平台、创新药物筛选平台,除了进行公司的研发项目外,还可为从事相关研究的团队和企业提供个性化服务。
威斯腾生物研发中心一直致力于高端分子诊断产品的创新研发,拥有国内外处于领先地位的核心技术包括超微量核酸快速提取技术、快速荧光原位杂交(FISH)技术,CRISPR/Cas9基因定点编辑技术,荧光量子点材料开发和运用,医学模式动物开发等。
重点研发领域包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌等恶性肿瘤的快速早期诊断,目前已成功开发非小细胞肺癌快速FISH诊断试剂盒、乳腺癌快速FISH诊断试剂盒、超微量粪便核酸快速诊断结直肠癌试剂盒等产品,其中非小细胞肺癌快速FISH诊断试剂盒入选重庆市技术创新与应用示范专项(产业类)重点研发项目名单,获中国生物医药创新创业项目最具投资价值TOP10评选赛北京站荣获一等奖、第八届中国创新创业大赛生物医药行业组重庆赛区冠军等。
同时,公司在重大传染病的快速检测及诊断上进行了研发布局,包括结核、EV71手足口病等重大传染病的快速诊断,拥有项目包括超微量尿液核酸检测结核试剂盒、量子点荧光标记传染病快速检测试剂盒等。新冠病毒疫情爆发后,威斯腾生物第一时间组建“新型冠状病毒试剂盒紧急研究小组”及“新型冠状病毒研发物资采购小组”,自筹经费成功研发新型冠状病毒(2019-nCoV)快速核酸检测试剂盒(免核酸提取荧光PCR一步法)、新冠病毒粪便RNA核酸提取试剂盒。产品已提供给20家以上的疾控中心和公共卫生中心使用,并与以上第三方疾控中心/公共卫生中心建立起了长期稳定的试用关系。
威斯腾生物是国家高新技术企业、科技型企业、市级新型研发机构、专精特新企业、北京市海淀区生物医药与大健康协会副会长单位、重庆市医药行业协会副会长单位。下属研发平台被认定为“中关村生物医药共享平台”、“中关村海淀区生物医药公共研发检测平台”、“重庆市生物医药检测共享平台”等。公司多次在全国性比赛中获奖,2019年荣荣获第八届中国创新创业大赛生物医药行业组重庆赛区冠军。
同时,威斯腾生物积极参与国际技术转移、成果转化相关合作,与美国、澳大利亚、新加坡等相关高校、研究院所建立了深厚的联系和多元化的合作,公司坚持以“技术创新、机制创新,文化创新,管理创新,战略创新”的理念,为重大恶性肿瘤、传染病疾病等领域的创新研发而不懈努力。
 

  核心竞争力

  • 荧光量子点材料开发和运用
  • 快速荧光原位杂交(FISH)
  • CRISPR/Cas9基因定点编辑技术
  • 基因芯片诊断
  • ChIP表观遗传研究
  • 医学模式动物开发

 

产业布局:

  • 科技服务
  • ctDNA,CTC液体活检
  • 病理医学诊断
  • PDX肿瘤筛查
  • POCT产品开发
  • IVD产品开发
  • 分子医学诊断
  • 创新研发系统

  行业交流

  2015年12月 由中国医药企业发展促进会、中国医药科技成果转化中心主办,重庆市医药 产业发展办公室指导,威斯腾生物医药承办的“首届2015·中国(重庆)生物医药前沿技术与产业化发展研讨会”在重庆渝州宾馆隆重举行;

  2016年4月  新加坡工程院院士、美国电子工程院连勇院士到威斯腾生物医药交流访问;

  2016年6月  美中药协(SAPA)总会前会长、美国强生公司研发总监、美国药学家协会院士戴卫国博士到威斯腾生物医药交流访问;

  2016年6月  威斯腾生物医药受邀参加第二届药学进展前沿高峰论坛;

  2016年8月  威斯腾生物医药受邀参加2016北京生物医药科技成果展示暨项目推介会;

  2016年10月  威斯腾生物医药受邀参加“科技部科技成果直通车暨首届科技成果路演活动”;

  2016年10月  威斯腾生物医药受邀参加2016中国(泰州)抗体药物高峰论坛;

  2016年11月  威斯腾生物医药受邀参加中国医药企业发展促进会第三次会员代表大会;

  2016年11月  威斯腾生物医药成为诺奖医学峰会投资委员会常务委员单位;

  2016年12月  威斯腾生物医药受邀参加北京市海淀区生物与健康产业协会第一届会员大会暨2016中关村核心区生物与健康产业发展高峰论坛;

  2017年1月   威斯腾生物医药受邀参加首届国际未来论坛;

  2017年1月   威斯腾生物医药受邀参加第二届中国天使两会双创年度盛典;

  2017年3月  北京生物技术和新医药产业促进中心潘悦主任一行到威斯腾生物医药交流访 问;

  2017年4月   威斯腾生物医药受邀参加四川省人民政府主办的医药健康产业深度合作和创新发展座谈会。

  企业文化

  公开透明的竞争文化机制

  竞争文化的培养是企业文化着重培养的重要内容,良好的竞争氛围使每位员工不甘落后和停滞。采取正确的竞争策略,能够极大地调动企业员工的积极性、创造性,焕发出竞争精神和创新精神,使人的潜能得到全面、充分地发挥,从而使整个企业的竞争能力得到全面地提高。

  公开透明的竞争机制的建立,使每位员工看到并享有畅通的晋升通道,保证每位员工在威斯腾都能一展所长。

  重视素质培养和全面发展

  威斯腾非常注重企业文化的建设,提倡“以人为本”的人才理念,关注员工的持续成长,倡导正能量,形成“勤奋,忠诚,热情,向上”的企业文化。

  素质是人的品质、能力、素养的总称,企业员工的职业素质是影响企业管理与发展的重要因素。高素质的人才,不在于经验的长久,而在于长久的经验培育出来的能力。提升员工素质是揭示各个方面及竞争力的利器。员工个人不仅可以参加企业组织的各种培训,还主动积极的进行自我学习与提高,不断的修炼自我,提高自身的职业素质,从而达到与时俱进,增强竞争力。

  和谐“家”文化

  公司提倡和谐“家”文化,致力于为员工提供良好的办公环境、营造轻松舒适的办公氛围,公司在对员工关怀上下足了工夫,让每一位企业员工真正感受企业文化的力量。”威斯腾管理委员会委员如是表示。一个好的公司,不能仅仅只注重品牌的打造,更要重视人才、重视技术、重视企业文化建设。这就是一个富有朝气,活力的威斯腾生物!


售后服务
欢迎致电威斯腾售后服务中心。 联系电话: 免费热线-4006756758 办公室电话-023-65316556
联系方式
单位名称:
详细地址:
重庆市高新区生物医药研发产业园
qq:
2857847515
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联系电话:

400-675-6758

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