活动说明

     历时多年的技术经验积累，国内外借助PacBio三代测序技术于细菌基因组学研究领域发表的论文已有数百篇，为了让中国科研者更好地完成科研项目，天津生物芯片现限时推出细菌基因组PacBio三代测序优惠大放送活动。 

细菌基因组通常比较小，大多在5MB以内，建议采用Pacbio RS II平台测1个SMRT Cell，获得800Mb-1.4Gb的数据，然后对于三代测序数据进行单独组装获得基因组完成图。三代测序平台的错误在于随机误差，因此可通过增加数据覆盖度显著降低错误率。

根据Pacbio官方提供的参考标准，细菌/真菌基因组覆盖大于80×,碱基准确度已接近99.99999%(QV70),即相当于每一千万个碱基中约发生一个碱基错误。以上研究方案在碱基准确度、基因组覆盖及组装结果方面均可获得较好结果。

技术优势

1，无GC偏好，对于GC%正常菌株和GC%异常菌株，Pacbio RS II 平台均可获得高质量测序数据；

2，可获得0 gap 基因组完成图，1个contig=1条染色体；

3，对于包含质粒的菌株，不仅可获得完整的细菌基因组，还可同时获得完整的质粒基因组序列。

成功案例

    2016年，天津生物芯片利用PacBio RS II平台，对GC含量高达70%的细菌进行了基因组完成图测序，仅用了1个cell测序，获得了超过1.2Gb的测序数据，实现该菌基因组200X以上测序覆盖，随后利用天津生物芯片自主研发软件进行De novo拼接，最终获得高准确性的基因组完成图。

关于TBC

   2013年，天津生物芯片率先在国内提供PacBio RS II三代测序服务，天津生物芯片已积累丰富的项目经验，成为中国三代测序技术应用的领跑者。2016年，天津生物芯片引进最新的美国三代测 序平台Sequel，以满足呈指数增长的三代测序服务需求，从而继续领跑中国三代测序服务市场。截止目前，公司在Nature、Nature Communications、PNAS等杂志累计发表SCI论文超过130篇，总影响因子超过500。

问题解答 
1、细菌完成图用第三代单分子测序Pacbio  RS II平台还是SEQUEL 平台？
       答：SEQUEL 单个CELL数据量大约5G，RS II单个CELL数据量1G，而细菌的话1G数据量足够完成图了。从技术上说，都可以，从成本上RS II更合适。

2、第三代单分子测序平台的单碱基准确率低，如何保证拼接结果的准确性？
      答： 第三代单分子测序平台的结果为单分子测序的结果，单碱基准确率仅为 87%，但其测序错误无偏好性，通过对某一个碱基的高覆盖，拼接结果的准确率可以达到 99.9% 以上。后续我们进一步利用高准确率的二代测序数据对拼接结果进行校正，确保最终拼接结果的准确率达到99.99% 以上。
3、项目周期以及工作日如何保证？
      答：  微生物基因组测序完成图为 20个个工作日。我们的工作日一般都是从样品提取检测合格的日期开始计算。个性化分析内容的项目周期需要视具体情况而定。

项目联系方式

天津生物芯片技术有限责任公司

地址：天津经济技术开发区海云街80号融通大厦A座B2-3 

电话：022-66229538                传真：022-66226983

邮箱：tjbiochipmk@126.com    QQ:2869494262

注：本活动最终解释权归天津生物芯片所有

公司概况:
天津生物芯片技术有限责任公司（天津市功能基因组与生物芯片研究中心）成立于2003年9月，由天津中新药业集团股份有限公司，南开大学，天津市创业投资有限公司，天津经济技术开发区国有资产经营公司共同出资组建，主要从事基因检测芯片的研发、基因组学和功能基因组学研究，是国家863专项资助的五个生物芯片研发基地之一，并且是唯一致力于病原微生物检测生物芯片的基地。公司坐落于天津经济技术开发区，总建筑面积4800平方米。
天津生物芯片技术有限责任公司致力于完成重要致病菌检测生物芯片的研发并形成产品，确立公司在国际微生物检测芯片研发领域的优势地位，建成综合、跨学科、开放、市场化的现代生物科技研发基地和较有规模的企业。
天津生物芯片技术有限责任公司将竭诚为我们的合作伙伴提供科研服务。我们在生物芯片技术,基因组学,蛋白组学,抗体制备和生物信息学的专长使我们能以优惠的价格为顾客提供及时上乘的服务。

科研团队及成就：
公司拥有一支以长江学者、南开大学特聘教授王磊博士为带头人的、高水平的研发梯队，现有研发人员90余人，科研人员中具有博士以上学历的20人，各学科学术带头人均具有海外学习和工作背景。至今已获得了包括中国科技部的“863项目”在内的多项科研基金数千万人民币,在Journal of Bacteriology和 Journal of Clinical Microbiology,Journal of Microbiological Methods,Gene等国际权威期刊上发表19篇文章。

实验室及设备：
在天津经济开发区的大力扶持下，公司已发展成一个初具规模的企业，总建筑面积约为4,800平方米，其中包括3，800平方米的先进实验基地。公司拥有基因组学、蛋白质组学、DNA/蛋白质及生物芯片等领域的先进仪器，并建立了以下的科研实验部门：生物芯片实验室、基因组学实验室、蛋白质组实验学和抗体实验室；生物信息平台；生物安全三级实验室和GMP生产车间。