WGBS甲基化测序-表观遗传学研究服务
基本信息
服务名称：
WGBS甲基化测序-表观遗传学研究服务
英文名称：
WGBS
参考报价：
请咨询：021-60901208
服务商：
总点击数：
3328
更新日期：
2015-08-19
服务类别：
服务详情
DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息，获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以新一代高通量测序平台为基础，进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。
技术路线
生物信息学分析
样品要求
1) 样品总量：≥ 3ug;
2) 样品浓度：≥ 50ng/ul。
3) 样品纯度：OD值260/280应在1.8～2.0;
4) 样品质量：基因组完整、无降解、无污染。
5) 样品包装：用封口膜密封样品，DNA低温运输（-20℃）。
应用案例
Conservation and divergence of methylation patterning in plants and animals Feng S，Cokus SJ et al.(2010) PNAS
背景：
1. 胞嘧啶甲基化是一种存在多种真核生物DNA中的表观遗传标记，尽管DNA甲基化多在基因沉默中有着保守的作用，但DNA甲基化的水平和模式在不同生物体中存在极大的差异。
2. 利用全基因组鸟枪法重亚硫酸测序（WGBS-Seq）,对雄蜜蜂、海鞘、小鼠、斑马鱼、绿衣藻、粳稻、拟南芥、杨树8个物种比较，利用得到的数据分析结果可以帮助研究者选择合适的模式生物进行研究，还可以证明WGBS-Seq的多功能性。
研究方法：
1.从雄蜜蜂、海鞘、小鼠、斑马鱼、绿衣藻、水稻、拟南芥、杨树8个物种的组织提取DNA。
2.WGBS-Seq测序文库构建。
3.Illumina GA 测序，分别得到118.4Mb-2.72Gb序列数据。
4.生物信息学分析。
结果分析:
1. 开花植物甲基化模式很类似，均检测到甲基化的胞嘧啶。而动物中基本都是CG甲基化。除CpG岛外，脊椎动物整个基因组都存在甲基化，且大多数生物基因组甲基化都很保守倾向于外显子，海鞘和蜜蜂中基因是主要的甲基化靶点，绿衣藻有特别的甲基化模式，非CG甲基化主要集中在基因的外显子而不是重复序列和转座子中。
2. Dnmt1(Mouse, Zebrafish)/ MET1 (Arabidopsis)的辅助因子Uhrf1(Mouse, Zebrafish)/VIM(Arabidopsis)有着保守的功能，维持小鼠、拟南芥和斑马鱼基因组中转座子和基因的CG甲基化。
参考文献
[1] Xiang H, Zhu J, Chen Q, et al. Single base-resolution methylome of the silkworm reveals a sparse epigenomic map. Nat Biotechnol 2010;28:516-20.
[2] Lister R, Pelizzola M, Dowen RH, et al. Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomicdifferences.Nature, 2009, 462:315-322.
[3] Feng S, Cokus SJ, Zhang X, et al.Conservation and divergence of methylation patterning in plants and animals.ProcNatlAcad Sci., 2010, 107:8689–8694.
公司简介
晶能生物技术（上海）有限公司（简称“晶能生物”）成立于2010年2月。自成立以来，高速发展，成为中国生物技术服务行业领先地位的公司。
晶能生物专注健康医疗产品和生命科学领域科技服务，抓住了中国健康医疗产业的巨大机遇和生命科学市场的快速成长势头，形成了以产品研发和科技服务为核心，涉足生命科学，临床疾病、人类健康等领域的产业化服务体系，在产品研发、人才建设、市场营销、销售渠道、专业服务等方面形成极具竞争优势的中国知名的高新技术企业。
晶能生物注重产品开发，成立创新健康医疗研究中心，资深的专家团队、国际先进的仪器设备，完善的管理和研发体系，让中心成为一个充满激情、力量雄厚、极具发展潜力的研发机构。
晶能生物通过ISO9001:2008质量体系认证, 并率先成为illumine CsPro和BioNano官方认证服务商。主要技术平台有BioNano单分子光学图谱平台、Illumina-Hiseq3000高通量测序平台、Illumina-Hiseq2500高通量测序平台、Illumina-Hiseq1500高通量测序平台、Illumina-Miseq高通量测序平台，Illumina-iScan基因芯片平台、Illumina-ECO Real Time PCR平台、Sequenome-质谱分析平台、曙光高性能服务器平台以及各种配套设备，完成项目达到近2000个，完成专利达到近10项，合作客户发表文章影响因子超过400。晶能生物已取得国内二代测序，基因芯片等市场的竞争优势，成为这个行业的领先者。
晶能生物奉行客户第一、共享快乐、共同成长、持续发展的原则，始终怀着感恩的心态，努力做一个让社会、客户、员工和股东满意的企业，并成为提供健康医疗产品和科技服务的领导性公司。
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