LncRNA测序及分析，数据深入挖掘
 
LncRNA-长链非编码RNA（Long noncoding RNA）是一类长度超过200nt的RNA分子，它们极少具有蛋白编码潜能，并且能够和DNA、RNA及蛋白质结合，以RNA的形式在多种层面上调控基因的表达水平。LncRNA测序是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有LncRNA和mRNA。 
 
样品要求
样品量：总量≧5ug；
样品浓度：浓度≧200ng/ul；
 
流程及内容
样品量首先是去除rRNA，建链特异性RNA文库后，HiSeq2500测序。
 
数据分析：
lncRNA分析：
lncRNA拼接
lncRNA位点筛选
lncRNA编码潜能分析
lncRNA描述性分析
lncRNA保守性分析
 
mRNA分析：
反义转录本鉴定
可变剪接分析
差异表达外显子分析
差异基因富集分析
TSS，TTS位点统计
SNP及插入缺失分析
 
lncRNA ，mRNA结合分析
基因组表达分布
表达水平分析
差异表达分析
lncRNA –mRNA共表达网络
Cis/Trans 作用分析
可视化结果
 
可根据客户需求进行个性化分析，提供分析代码，客户可重现分析。
 
另：提供单细胞测序等。

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