测序/合成

转录组测序服务

基本信息
服务名称:
转录组测序服务
英文名称:
mRNASeq
参考报价:
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总点击数:
1459
更新日期:
2017-03-13
服务类别:

服务详情

转录组是对特定组织或者特定细胞在某个时期转录出来的所有mRNA进行测序。从整体水平研究基因功能以及基因结构,全面快速地获得mRNA序列。已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

 

生物信息分析内容

 

分析内容

数字基因表达谱(DGE)

真核转录组

原核转录组

有参考序列

无参考序列

有参考序列

无参考序列

数据质控

与参考基因组比对

 

 

序列组装(contig、Unigene长度统计)

 

 

 

基因表达水平分析

RNA-seq整体质量评估

 

 

 

差异基因筛选及聚类分析

GO/KEGG富集分析(mRNA或非编码RNA的靶基因)

蛋白互作网络分析(mRNA或非编码RNA的靶基因)

 

 

转录因子注释(仅对人和小鼠)

 

 

 

SNP/Indel分析

 

 

 

反义转录本预测(链特异性测序)

 

 

 

新转录本预测

 

 

 

可变剪切

 

 

 

 

基因功能注释

 

 

 

ORF预测

 

 

 

SSR分析

 

 

 

融合基因分析(仅针对肿瘤样本)

 

 

 

 

 

 

技术参数

 

样本类型

总量&浓度

目标RNA富集方式

文库类型

推荐数据量

测序策略

项目周期

数字基因表达谱(DGE)

 

 

Total RNA

 

m≥2 μg

c≥50 ng/μL

Olig dT磁珠调取mRNA

普通转录组文库

≥3G clean data

HiSeq PE150

35个工作日

真核转录组

m≥2 μg

c≥50 ng/μL

Olig dT磁珠调取mRNA

普通转录组文库

≥8G clean data

HiSeq PE150

35个工作日

原核转录组

m≥5 μg

c≥65 ng/μL

Ribozero试剂盒去除rRNA

普通转录组文库/链特异性文库

≥2G clean data (有参)

≥3G clean data(无参)

HiSeq PE150

35个工作日

 

结果示例
 
GO注释
 
KEGG注释
 
差异表达基因火山图
 
 
差异基因表达模式聚类图
 
差异表达富集通路统计分析图
 

 

深圳承启生物科技有限公司

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QQ业务咨询:2796053217

网址:http://www.chi-biotech.com

邮箱:service@chi-biotech.com

地址:深圳市南山区泰邦科技大厦15C

公司简介

承启生物是一家汇集世界顶尖科研成果、立足珠三角地区、辐射全球的高科技生物公司。公司拥有完全自主研发、已被学界公认的超高精度基因测序分析算法,致力于用领先业界的基因研究技术造福科研及医疗。

本公司的核心技术团队由在分子生物学、大规模测序、生物信息学、临床医学等领域的做出突出贡献的专家组成,他们在国内外具有相当的知名度和学术影响力。该团队在国际上首次建立了一系列基于大规模测序的高精度实验与应用技术,可以为科研和医疗领域的单位客户或个人客户提供方便快捷、准确详尽、高度定制化的大规模精确测序与信息分析服务。


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