lncRNA 测序（long non-coding RNA）是指长度超过200nt的长链非编码RNA，是非编码RNAs(non-coding RNAs，ncRNAs)的重要组成部分。参与了基因组印记、转录激活、转录抑制等多种重要的调控过程，lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。

生物信息分析内容

1、数据产出统计和质量评估

2、与参考基因组比对 

3、基因表达水平分析

4、RNA-seq整体质量评估

5、lncRNA 编码潜能分析、保守性分析、exon个数统计

6、差异基因筛选及聚类分析

7、差异mRNA或lnc RNA的靶基因GO、KEGG Pathway富集分析

8、差异mRNA或lnc RNA的靶基因蛋白互作网络分析

9、新转录本预测

10、反义转录本预测(链特异性测序)

11、差异非编码RNA靶基因预测

12、转录因子注释（仅对人和小鼠）

13、SNP/Indel分析

14、可变剪切分析

15、lncRNA-mRNA 共表达网络构建

技术参数

样本类型：total RNA

样本要求：总量≥4 μg，浓度≥120 ng/μL

文库类型：链特异性文库

测序策略：HiSeq PE150，推荐数据量：≥10 G clean data

项目周期：45个工作日

结果示例

三种主要类型lncRNA数目统计

差异表达基因火山图

共表达聚类树

特定关注lncRNA与coding基因共表达模块相关性矩阵热图

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