SNaPshot法SNP分型
一.试验原理
该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得,通常用于10-30个SNP位点分析。
二.试验流程
三.优点
1、通量高,一次反应可扩增最多10-15个位点;
2、数据完整性高,相对于MassArray高通量分析的时候经常发生个别样本失败或者个别位点丢失的情况,MassArra方法丢失的数据进行补充造价很高,一般不会补,而该方法可以以较低成本补充实验;
3、适应性强,实验结果可靠,该方法是ABI公司在10多年前开发成功的,历经了很多验证,发表了大量文章。
四.送样要求:
1、组织样本:-20℃或-80℃低温冰箱中保存,液氮或者干冰运输;市内或短途运输可冰袋运输。若提供的材料为新鲜组织、血液细胞等生物材料,请提供足够提取2ug以上基因DNA的材料量。
2、DNA样本:体积≥50ul,浓度≥50ng/ul,DNA总量≥2ug,纯度 OD260/280 在1.7~1.9之间,不含PCR抑制剂,须注明准确浓度。样品须低温冰袋运输。
3、血液样本:要求保存于抗凝管中或冻存管中,体积大于2ml,请用干冰运送,保证DNA不降解。
4、样品为石蜡包埋组织切片的,要求提供10张组织切片光片(面积>10mm×10mm,厚度约5-10um)。
北京博友顺生物技术有限公司,经过几年的发展公司更专业于分子标记技术服务。公司致力于:基因组SSR引物开发、AFLP检测、SSR/STR技术服务、ISSR、MSAP、SNP基因分型、条形码分析、克隆分子实验。本着“质量第一,服务至上”的原则为各大院校、医院、科研院所等单位,提供优质的产品和服务,最大程度的满足用户的需要。
公司感谢广大老师五年来对公司的厚爱和支持,将再接再厉为广大老师做好科研后勤工作。我们非常庆幸能成长在生物行业刚刚起航的年代里,能跟随各位老师前辈们共进步、共成功
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