DNA甲基化检测服务
背景介绍
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5'-端的胞嘧啶转变为5'-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。脊椎动物DNA的甲基化状态与生长发育调控密切相关,比如在肿瘤发生时,抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加, CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态,导致抑癌基因表达的下降。阅微基因通过以下方法提供甲基化检测服务。
服务项目
1、甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
2、亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,这种方法称为BSP-克隆测序法。
3、甲基化敏感扩增多态性(Methylation-Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)
MSAP是利用对DNA甲基化敏感的两种同裂酶Hpa II和Msp I来对基因组DNA进行酶切和连接。由于两种酶能够识别相同的限制性酶切位点,即CCGG位点。当DNA序列中的CCGG位点出现不同程度的甲基化状态时,会分别被这两种酶识别,以有无产物的方式体现出来。
4、焦磷酸测序(Pyrosequencing)
通过准确定量单个连续的CpG 位点上的甲基化频率,焦磷酸测序能检测并定量甲基化水平上的细微改变。在序列延伸过程中,根据C和T的掺入量来定量确定单个位点的C-T比例。因此,不同位点的甲基化变异就能被准确检测。由于焦磷酸测序提供了真实的序列数据,甲基化状态也就以序列形式呈现。
服务编号
送样要求
细胞(≥106个)、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、血清(≥1.5ml)等样品材料,基因组DNA(体积≥20μl,浓度≥50 ng/μl)。
提供结果
成功案例
某客户检测病例组样本启动子区域甲基化情况,该区段共有39个CpG位点,一共提供10个克隆,该样本的甲基化程度为2.3%。
SP检测CpG甲基化区段点状图结果示例
北京阅微基因技术股份有限公司(证券简称:阅微基因,证券代码:873723.NQ)主要从事多基因联合检测产品的研发、生产和销售业务,并基于中等通量基因检测技术平台为下游客户提供技术服务及创新解决方案,产品及服务广泛应用于临床医学、法庭科学、工农业及其他领域。
阅微基因总部位于北京市海淀区中关村科技园区,在北京和苏州均设有GMP生产基地,并在全国设有多个子公司及技术服务中心,2018年阅微基因在哈萨克斯坦成立海外子公司,开始积极拓展海外业务。公司迄今已获数十项发明专利及软件著作权,多年来持续获得国家高新技术企业认证,并荣获2020年北京市专精特新“小巨人”企业称号、工业和信息化部第二批专精特新“小巨人”企业称号。
阅微基因以市场需求为导向,充分发挥在基因检测领域的技术积淀,以“中通量荧光PCR-毛细管电泳平台”为核心技术平台,形成检测设备、检测试剂及软件系统开发和服务等关键能力,致力于重大疾病谱的临床医学领域和法庭科学基因检测领域的技术进步和产品开发,逐渐成为国内基因检测领域具有设备、试剂、软件一体化优势的创新企业。
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