分子与细胞

DIA磷酸化蛋白质组学

基本信息
服务名称:
DIA磷酸化蛋白质组学
英文名称:
参考报价:
面议
总点击数:
1370
更新日期:
2023-04-23
服务类别:

服务详情

采用IMAC富集策略提升S, T, Y磷酸化修饰肽段数量的同时,基于数据非依赖采集(Data-Independent Acquisition,DIA)技术,无偏向性采集质谱扫描范围内所有信号,解决磷酸化修饰的定性定量难题,实现低丰度修饰信息采集向“全息扫描”飞跃。

实验流程
 
 
应用方向
▶ 临床大队列样本分析,如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型;
▶ 作物群体性状等大规模样本研究,如育种品系、胁迫干预等;
▶ 临床生物标志物发现:DIA接近MRM的定量能力,实现标志物筛选与初步验证过程合二为一;
▶ 生物样本信息库构建:DIA可实现生物信息的完整保存,为后续回溯分析提供保障;
▶ 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析;
▶ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究;
▶ 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路;
▶ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析;
▶ 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究;
▶ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。

 
数据分析
 
 
技术优势
▶ 全扫描模式:数据非依赖性采集模式,大大减少高丰度干扰,全面采集高低丰度信号,数据覆盖度提高近40%;
▶ 超高重现性、稳定性:大样本鉴定重复率提升近40%,定量精密度提升近1倍;
▶ 超高定量准确度:定量能力接近金标准SRM/MRM靶向技术。
 
推荐组合产品:
(1)    临床大队列研究“黄金”联合:DIA蛋白质组+DIA磷酸化蛋白质组;
(2)    4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白质组;
(3)    标志物研究“一站式”解决方案:DIA蛋白质组+PRM。
 
参考文献

1.Oncogenic Mutations Rewire Signaling Pathways by Switching Protein Recruitment to Phosphotyrosine Sites. Cell. 2019.
络氨酸磷酸化-肺组织-通过酪氨酸磷酸化高通量组学揭示了EGFR突变体的致癌特性
2.Multi-level proteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV. bioRxiv. 2020.
DIA磷酸化蛋白组学-人细胞-通过检测病毒感染后细胞整体的蛋白质组、磷酸化蛋白质组、泛素化蛋白质组学以及转录组学,揭示了新冠病毒与SARS病毒对宿主产生扰动机制的异同点
3.Integrated Omics of Metastatic Colorectal Cancer. Cancer Cell. 2020.
DIA磷酸化蛋白组学-肿瘤组织-通过蛋白质组和磷酸化蛋白组学,揭示原发性结直肠肿瘤与其肝转移之间存在显着的异质性,并通过激酶-底物相关性网络分析有效锁定潜在的治疗药物

公司简介
中科新生命(APTBIO)自2004年成立以来,已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部,是最早参与国际HLPP(肝脏)、HPPP(血浆)项目的平台之一,已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者,中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇;获得各项发明专利和专业著作权数十项;并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统(LIMS),强化了实验室质量监测和质量管理,保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念,整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据,为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。

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