测序/合成

N端测序

基本信息
服务名称:
N端测序
英文名称:
参考报价:
面议
总点击数:
2926
更新日期:
2023-04-23
服务类别:

服务详情

——即蛋白质N端氨基酸序列分析技术服务

“Edman降解,蛋白质化学的经典方法,氨基酸序列分析的金标准之一。”

Edman降解法是异硫氰酸苯酯(PITC)在弱碱(TMA)条件下与蛋白质N端α-氨基偶联生成苯氨基硫甲酰肽(PTC-蛋白质),然后在无水强酸(TFA)条件下,N端的第一个残基从完整的多肽、蛋白链上以2-苯氨基噻唑啉酮(ATZ-AA)的形式裂解下来,之后在稀酸(25% TFA)条件下,ATZ-AA转化为更加稳定的苯基乙内酰硫脲衍生物,即PTH-氨基酸,生成的PTH-AA输送至高效液相色谱中进行在线分析,剩下的多肽蛋白样品可反复进行上述处理,依次生成各种PTH-AA,经液相系统色谱柱分离可以确定被测多肽蛋白质供试品N端的氨基酸排列顺序。

 

技术流程

 

技术特点

  •  
  •   可靠性最高的测序方法

■  对蛋白质多肽样品的纯度要求很高

■  非标准氨基酸无法测定

分析应用

“Edman降解法N端测序在未知蛋白的测序方面发挥不可替代的作用。”

蛋白质的生物合成均起始于N端,其N端序列的组成对生物学功能有着巨大的影响,例如蛋白质的半衰期、蛋白质在亚细胞器中的定位等等。并且N端可发生多种翻译后修饰,这些也与蛋白质的功能和稳定性息息相关。因此,对于蛋白质N端序列的分析,有利于帮助分析蛋白质的高级结构,揭示蛋白质的生物学功能。并且随着现代医药工业的发展,出现了大量的蛋白质和多肽类药物分子,对这些蛋白质多肽类药物分子N端序列的分析确认也是医药工业质量控制的重要环节。

技术指标

■  样品要求:

     纯度不低于95%;蛋白质样品N端未封闭;提供样品的相对分子质量;样品含量不低于10 μg。

■  仪器设备:

           全自动蛋白仪·多肽N端测序仪(SHIMADZU型号:PPSQ-33A)

■  分析软件:

           PPSQ-30-Analysis、PPSQ-30-Data processing

           色谱柱(WAKO型号:Wakosil-PTH (4.6 mm*250 mm))

■  实验原理:

 

Edman降解法原理图

案例分析

      案例一:抗体类蛋白质的轻重链分析和N端氨基酸序列测定

样品名称:XXXXXXX理化测定对照品

批号:XXX-XXX-XXXX-X

样品状态:PVDF膜(抗体)

样品重链理论序列为:NH2-X-X-X-X-X-X-X-X-X-X

谱图结果:

 

     

案例二:未知序列蛋白质类样品的N端氨基酸序列分析

样品名称:未知

样品状态:PVDF膜

样品理论序列:未知

谱图结果:

Q&A

1)    N端测序仪的介绍。

多肽蛋白质N端测序仪生产制造商主要有美国ABI公司和日本SHIMADZU公司。两家公司的仪器均是基于Edman降解原理进行N端测序,只是在后续的PTH-AA色谱分离条件方面存在差异。随着后来ABI公司逐渐退出N端测序仪市场,相应的仪器也已停产,使得SHIMADZU公司现在成为N端测序仪方面的主要制造商,其主要的N端测序仪型号为:PPSQ-33A、PPSQ-31A。

2)    Edman方法和质谱方法的比较介绍。

Edman降解法和质谱分析方法作为现有主要的蛋白质样品N端分析方法,有其各自的优缺点。Edman降解法作为现有蛋白质样品N端序列测试的黄金标准,已得到广泛应用,但还是存在不足之处,其通量较低,每个残基测试需花费45分钟时间,且每个残基测试的费用成本较高,对于N端封闭的蛋白质样品无法直接进行N端测序。

质谱法分析作为蛋白质样品N端分析的另外一种手段,其通量高,成本相对较低,对N端封闭样品可以进行测试,但其对于未知序列的蛋白质难以做出正确判断,且无法区分分子量相近的氨基酸(I/L、Q/K),所以两种方法蛋白质样品N端测序过程中可以相互进行补充。

3)    N端氨基酸测序的样品准备过程。

PVDF膜蛋白质样品可直接进行N端测序。N端测序对样品纯度要求较为严格,如果样品纯度低于95%需进行电泳分离纯化,之后电转印至PVDF膜上进行N端测试。如果样品纯度高于95%,可进行简单处理后进行N端测试,处理过程为:液体样品可直接通过prosorb转移至PVDF膜上,固体样品用0.1% TFA溶液溶解后用相同方法亦转移至PVDF膜上,之后切取样品膜进行测试,如为小肽样品或测试循环数较多(>20)需进行样品固定处理。

公司简介
中科新生命(APTBIO)自2004年成立以来,已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部,是最早参与国际HLPP(肝脏)、HPPP(血浆)项目的平台之一,已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者,中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇;获得各项发明专利和专业著作权数十项;并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统(LIMS),强化了实验室质量监测和质量管理,保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念,整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据,为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。

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