芯片与生物信息学

全转录组测序

基本信息
服务名称:
全转录组测序
英文名称:
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总点击数:
661
更新日期:
2016-09-27
服务类别:

服务详情

欧易特色

 


● 丰富的建库经验,优秀的建库质量:12年文库构建技术沉淀,具有极强的复杂样品处理能力和丰富的建库经验
● 临床研究级数据产出,质量和数量完美结合:国内唯一获得美国CLIA认证的测序实验室,全程采用精益管理和5S实验室规范 
● 结合客户的需求,灵活进行定制化信息分析
● 独具特色的高级分析:lncRNA调控机制预测,lncRNA和mRNA的共表达分析,lncRNA、mRNA和circRNA的联合分析等

 

推荐测序模式


● Hiseq4000,PE150 
● 一般测序:12 Gb/样本 
● 深度测序:20 Gb/样本

 

数据分析内容


标准数据分析

● 原始测序数据质控   ● 测序数据质量评估   ● Reads污染检测   ● 参考基因组比对

● QC分析  ● mRNA分析(转录本/基因表达丰度分析、差异表达转录本分析) 

● lncRNA分析(转录本重建/组装分析、潜在长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA特征分析、lncRNA表达量分析、差异lncRNA表达分析)

● circRNA分析(circRNA鉴定、cirRNA来源基因注释、circRNA基因结构分析、circRNA表达丰度分析、circRNA差异表达分析)

高级数据分析

● mRNA分析

● lncRNA分析

● lncRNA分析

● circRNA分析 (circRNA-mRNA互作分析、互作网络图绘制)  ● ceRNA分析 ● WGCNA分析
 

全转录组测序样品要求


● Total RNA:≥4 μg 

● OD260/280为1.8-2.2

● 适用范围:有参考基因组物种

 

公司简介

售后服务
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