全转录组测序
欧易特色
● 丰富的建库经验,优秀的建库质量:12年文库构建技术沉淀,具有极强的复杂样品处理能力和丰富的建库经验
● 临床研究级数据产出,质量和数量完美结合:国内唯一获得美国CLIA认证的测序实验室,全程采用精益管理和5S实验室规范
● 结合客户的需求,灵活进行定制化信息分析
● 独具特色的高级分析:lncRNA调控机制预测,lncRNA和mRNA的共表达分析,lncRNA、mRNA和circRNA的联合分析等
推荐测序模式
● Hiseq4000,PE150
● 一般测序:12 Gb/样本
● 深度测序:20 Gb/样本
数据分析内容
标准数据分析
● 原始测序数据质控 ● 测序数据质量评估 ● Reads污染检测 ● 参考基因组比对
● QC分析 ● mRNA分析(转录本/基因表达丰度分析、差异表达转录本分析)
● lncRNA分析(转录本重建/组装分析、潜在长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA特征分析、lncRNA表达量分析、差异lncRNA表达分析)
● circRNA分析(circRNA鉴定、cirRNA来源基因注释、circRNA基因结构分析、circRNA表达丰度分析、circRNA差异表达分析)
高级数据分析
● mRNA分析
● lncRNA分析
● lncRNA分析
● circRNA分析 (circRNA-mRNA互作分析、互作网络图绘制) ● ceRNA分析 ● WGCNA分析
全转录组测序样品要求
● Total RNA:≥4 μg
● OD260/280为1.8-2.2
● 适用范围:有参考基因组物种
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详细地址:
上海浦东张江高科技园区祖冲之路1505弄138号6层
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