真核转录组测序
欧易特色
● 极强地处理复杂样本的能力
● 丰富的建库经验,加入文库均一化技术
● 协助客户快速、高效、准确性地进行生物信息分析可结合客户的需求
● 灵活进行定制化信息分析
样品要求
● RNA大于等于5ug
● OD260/280为1.8-2.2
● 适用范围:有无参考基因组皆可
A.真核生物转录组测序(有参考基因组物种)
真核生物转录组测序项目流程
推荐测序模式
● HiSeq4000, PE150
● 6Gb/每个样本
数据分析内容
标准数据分析
● 测序数据质量评估 ● Reads污染检测 ● 参考序列比对
● 差异基因统计分析 ·聚类分析 ·GO富集分析 ·KEGG富集分析
高级数据分析
● 基因结构优化 ● 新转录本预测 ● 可变剪切分析 ● SNP和Indel分析
● 功能层次网络构建 ● 信号通路网络构建 ● 时间序列分析
● 加权基因共表达网络构建(WGCNA) ● 基因表达趋势分析(STC)
B.真核生物转录组测序(无参考基因组物种)
真核生物转录组测序项目流程
推荐测序模式
● HiSeq4000, PE150
● 测序数据量根据物种基因组大小而定
数据分析内容
标准数据分析
● 测序数据质量评估 ● Reads污染检测 ● De novo组装 ● Unigene注释
● 差异基因统计分析 ·聚类分析 ·GO富集分析 ·KEGG富集分析
高级数据分析
● 信号通路网络构建 ● 功能层次网络构建 ● 时间序列分析
● 加权基因共表达网络构建(WGCNA) ● 基因表达趋势分析(STC)
单位名称: |
详细地址:
上海浦东张江高科技园区祖冲之路1505弄138号6层
|
qq:
|
官网: |
联系电话: |
Email: |