芯片与生物信息学

真核转录组测序

基本信息
服务名称:
真核转录组测序
英文名称:
参考报价:
总点击数:
746
更新日期:
2016-09-27
服务类别:

服务详情

欧易特色

● 极强地处理复杂样本的能力
● 丰富的建库经验,加入文库均一化技术
● 协助客户快速、高效、准确性地进行生物信息分析可结合客户的需求
● 灵活进行定制化信息分析

样品要求

● RNA大于等于5ug 

● OD260/280为1.8-2.2 

● 适用范围:有无参考基因组皆可

 

A.真核生物转录组测序(有参考基因组物种)

真核生物转录组测序项目流程

真核生物转录组测序(有参考基因组物种)

 

推荐测序模式

● HiSeq4000, PE150 

● 6Gb/每个样本

 

数据分析内容

标准数据分析

● 测序数据质量评估   ● Reads污染检测  ● 参考序列比对

● 差异基因统计分析  ·聚类分析 ·GO富集分析 ·KEGG富集分析

 

高级数据分析

● 基因结构优化   ● 新转录本预测  ● 可变剪切分析   ● SNP和Indel分析

● 功能层次网络构建   ● 信号通路网络构建  ● 时间序列分析

● 加权基因共表达网络构建(WGCNA)  ● 基因表达趋势分析(STC)

 

B.真核生物转录组测序(无参考基因组物种)

真核生物转录组测序项目流程

真核生物转录组测序(无参考基因组物种)

 

推荐测序模式

● HiSeq4000, PE150 

● 测序数据量根据物种基因组大小而定

 

数据分析内容

标准数据分析

● 测序数据质量评估   ● Reads污染检测  ● De novo组装 ● Unigene注释

● 差异基因统计分析  ·聚类分析 ·GO富集分析 ·KEGG富集分析

 

高级数据分析

● 信号通路网络构建   ● 功能层次网络构建  ● 时间序列分析

● 加权基因共表达网络构建(WGCNA) ● 基因表达趋势分析(STC) 

公司简介

售后服务
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上海浦东张江高科技园区祖冲之路1505弄138号6层
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