lncRNA测序
服务详情
欧易特色
● 技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993
● 高特异性：使用特定方法降低样本中rRNA的丰度
● 高准确度：构建链特异性转录组文库，快速、高效、准确地获取样本中几乎全部的lncRNA序列及其位置信息
● 分析严格：系统鉴定已知lncRNA，设置严格的筛选条件用于发现新的lncRNA
● 独具特色的lncRNA高级分析：lncRNA cis和trans调控机制以及ceRNA调控机制等
● 经验丰富：已对多种动植物的lncRNA进行测序分析
lncRNA测序项目流程
推荐测序模式
● Hiseq4000, PE150
● 一般测序：10 Gb/样本
● 深度测序：20 Gb/样本
数据分析内容
标准数据分析
● 原始测序数据质控 ● 测序数据质量评估
● Reads污染检测 ● 参考基因组比对
● 转录本重建/组装分析 ● 潜在长链非编码RNA挖掘
● 长链非编码RNA特征分析 ● lncRNA表达量分析
● 差异表达分析
高级数据分析
● lncRNA-mRNA共表达分析 ● ceRNA分析
● lncRNA cis、trans分析 ● WGCNA分析
lncRNA测序样品要求
● Total RNA：≥2 μg
● OD260/280为1.8-2.2
● 适用范围：有参考基因组物种
公司简介
售后服务
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上海浦东张江高科技园区祖冲之路1505弄138号6层
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