测序/合成

ChIP测序

基本信息
服务名称:
ChIP测序
英文名称:
参考报价:
总点击数:
1539
更新日期:
2021-08-19
服务类别:

服务详情

 染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典技术,被广泛应用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。

云序生物ChIP-Seq服务,将ChIP和高通量测序技术结合,在全基因组范围内高效地检测与特定转录因子或组蛋白结合的DNA位点。详见:云序生物 ChIP测序

 

技术优势

  • 优化的ChIP流程:ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的
  • 优化的ChIP流程:云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得优质的数据
  • 严格的质控:云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险
  • 专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求

 

数据分析

基本分析

高级分析

1.  原始数据整理,过滤和质量评估

CS-CHI-001.  蛋白结合基因的GO和信号通路分析

2.  序列匹配与数据统计

CS-CHI-002.  蛋白在样品间差异结合分析

3.  图形化展示测序reads的基因组分布

CS-CHI-003.  差异结合基因的GO和信号通路分析

4.  蛋白结合区域识别(peak calling)

 

5.  蛋白结合区域注释,分布统计

 

 

数据展示

 

云序服务内容

1. 测序服务

转录组

表观遗传组

基因组

真核生物

原核生物

miRNA测序

细菌sRNA测序

MeDIP测序

目标序列靶向测序

小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)

原核生物mRNA测序

RRBS测序

外显子组测序

lncRNA测序

宏转录组测序

全基因组甲基化测序

人类基因组重测序

环状RNA测序

原核生物转录组测序

ChIP测序

16S rDNA测序

mRNA测序

原核De novo转录组测序

 

宏基因组测序

RIP测序

 

 

 

降解组测序

 

 

 

转录组测序

 

 

 

De novo转录组测序

 

 

 

 

2. 生信服务 & PCR技术服务

 

生信服务

实时定量PCR服务

转录组

表观遗传组

基因组

联合分析

环状RNA分析

DNA甲基化分析

基因组分析

circRNA-miRNA

功能分型PCR芯片

lncRNA分析

ChIP测序分析

微生物菌落分析

LncRNA-mRNA

环状RNA实时定量PCR

mRNA分析

 

宏基因组分析

LncRNA-miRNA-mRNA

LncRNA实时定量PCR

microRNA分析

 

 

 

miRNA实时定量PCR

细菌sRNA分析

 

 

 

mRNA实时定量PCR

宏转录组分析

 

 

 

 

 

公司简介

上海云序生物科技有限公司于2015年成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等核心技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的创新技术企业。
云序生物聚焦科研前沿领域,是国内率先开展RNA修饰,转录组及eccDNA研究的创新性企业,提供各类RNA修饰,各类RNA分子(mRNA及非编码RNA),各类测序技术(IP类,单碱基类)及eccDNA系统性解决方案。云序作为国内表观修饰&转录组领域的领军者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系,合作单位包括超过300家科研院所和高校、200余家医院等,目前已成功完成人、动植物、原核生物等在内的数百个物种;组织、细胞、血清、血浆、胎盘、视网膜,房水等不同种类型,累计上万个样本的实验及数据分析服务,参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇,影响因子累积10000+。
 


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