lncRNA测序
长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度超过200nt,不编码蛋白质的RNA分子。这类RNA分子在表观遗传水平、转录水平以及转录后等水平调控基因的表达,广泛参与各种生理学过程,与癌症、心血管疾病、神经退行性疾病等多种人类疾病密切相关。目前,LncRNA已经取代miRNA成为近几年来最耀眼的明星RNA分子,是国际上的研究热点。
云序生物提供的LncRNA测序服务同时分析特定样品中的所有LncRNA和mRNA,并根据已知数据库和文献对LncRNA进行详细注释,能够帮助客户筛选与特定生物学过程或疾病相关的LncRNA,并为后续的LncRNA功能和机制研究提供极大的便利。详见:云序生物 lncRNA测序
云序特色
全面检测所有LncRNA:约有20%的LncRNA没有Poly(A)尾巴,如果采用Oligo d(T)富集法会丢失这部分LncRNA信息。云序生物拥有市面上最全的,针对不同物种的去rRNA试剂盒,能够保留所有LncRNA
适用于降解样品:采用特有的、可适用于降解样品的去rRNA试剂盒,能够最大程度地保留降解样品中的LncRNA信息。尤其适合于临床样品的LncRNA检测
链特异性检测:采用链特异性建库方法,可准确检测反义LncRNA,提供最全面的LncRNA信息
专业化的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析
基本分析 |
高级分析 |
1. 原始数据整理,过滤和质量评估 |
CS-LNC-001. LncRNA靶基因共表达网络分析(CNC) |
2. 基因组匹配与数据统计 |
CS-LNC-002. LncRNA靶基因集信号通路富集分析(LncRNA-GSEA) |
3. LncRNA识别和注释(含mRNA) |
CS-LNC-003. LncRNA临近靶基因GO和信号通路分析 |
4. LncRNA表达量计算(含mRNA) |
CS-LNC-004. LncRNA-miRNA-mRNA互作网络分析 |
5. 差异LncRNA筛选(含mRNA) |
CS-LNC-005. LncRNA上游转录因子分析 |
6. 差异mRNA的GO和信号通路分析 |
CS-LNC-006. 新LncRNA预测 |
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CS-LNC-007. LncRNA分子标志物筛选 |
数据展示
云序服务内容
1. 测序服务
转录组 |
表观遗传组 |
基因组 |
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真核生物 |
原核生物 |
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2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 |
实时定量PCR服务 |
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转录组 |
表观遗传组 |
基因组 |
联合分析 |
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上海云序生物科技有限公司于2015年成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等核心技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的创新技术企业。
云序生物聚焦科研前沿领域,是国内率先开展RNA修饰,转录组及eccDNA研究的创新性企业,提供各类RNA修饰,各类RNA分子(mRNA及非编码RNA),各类测序技术(IP类,单碱基类)及eccDNA系统性解决方案。云序作为国内表观修饰&转录组领域的领军者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系,合作单位包括超过300家科研院所和高校、200余家医院等,目前已成功完成人、动植物、原核生物等在内的数百个物种;组织、细胞、血清、血浆、胎盘、视网膜,房水等不同种类型,累计上万个样本的实验及数据分析服务,参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇,影响因子累积10000+。
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