分子与细胞

SILAC定量|SILAC定量蛋白质组

基本信息
服务名称:
SILAC定量|SILAC定量蛋白质组
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总点击数:
5182
更新日期:
2017-02-17
服务类别:

服务详情

  SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技术是利用哺乳动物细胞增殖对必需氨基酸的依赖性原理而设计的代谢标记蛋白质的方法。SILAC技术应用于定量蛋白质组研究,为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案,是目前的、进行细胞中蛋白质相互作用和蛋白质表达差异的定量蛋白质组学技术。

  金开瑞提供SILAC定量蛋白质组技术服务,可用于多个样品或同一样品不同条件下全细胞蛋白或亚细胞蛋白的差异比较,直接判定蛋白质表达水平差异、区分特异性和非特异性相互作用等。与其他相对定量的质谱技术相比,存在灵敏度高、定量准确,且实验误差小等优势

 

一、服务特色

技术特点

1、高效性:SILAC是体内标记技术,标记效率可高达100%;

2、定量精确,线性范围广,降低由于样品制备、实验操作和仪器设备造成的实验误差,定量重复性好;

3、体内代谢标记与SDS-PAGE或色谱分离技术相结合,兼容疏水性蛋白和偏碱性蛋白,不受蛋白性质限制;

4、由于该技术属于体内标记,标记效果稳定,其标记效率不受裂解液的影响,不仅适合于进行全细胞蛋白的分析,还适合于膜蛋白的鉴定和定量;

5、与化学标记相比,SILAC方法蛋白需要量明显减少,通常每个样品只需要几十微克的蛋白量;

6、活体标记,更接近样品真实状态;

7、相容性:可以对多种在DMEM或RPMI 1640培养基中能够培养的细胞或细菌中表达的蛋白进行标记。

 

适用范围

只适用于活体培养的细胞,对于生物医学研究中常用的组织样品,体液样品等无法分析,对于动物模型的标记成本太大,无法实现物种已知基因组序列、ESTs或蛋白质组全库序列。

 

二、服务说明

服务流程

接受订单及样品——蛋白提取——SDS-PAGE分离——蛋白酶解——HPLC分离——LC-MS/MS——数据解析——结果交付

客户提供

需鉴定的样品;

样品信息单,需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付

实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。

生物信息学分析内容包括:

SWATH 参考谱图数据库构建:通过DDA模式的扫描结果,谱图数据库构建、全谱鉴定及结果可靠性评估

SWATH定量:根据二级碎片离子的全扫描结果实现二级离子的定量;SWATH结果可靠性分析;差异表达分析;层次聚类;PCA分析等。

蛋白质功能注释:包括GO注释、COG分类和KEGG Pathway分析

差异蛋白功能富集:包括GO富集、Pathway富集

差异蛋白网络互作:基于STRING 数据库的PPI分析,基于Cytoscape的可视化展示

 

三、服务周期及报价

服务周期

自送样起45个工作日。

服务报价

请询价。

 

如您对SILAC定量感兴趣或者需要技术支持,请您与我联系QQ:3013422302 ,或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/,可以搜索到您想要的服务信息,武汉金开瑞生物有限公司期待和您的合作。

公司简介

武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地,是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。
关注蛋白整体研究思路,围绕蛋白的读、解、写、用,金开瑞建立起蛋白组、检测分析、基因服务、病毒包装、蛋白表达、抗体制备六大核心技术平台。所有平台的实验室及技术团队都坚持自主建设,各平台技术负责人都有5年以上相关领域的工作经验,可以最大程度的保障了项目按时保质的实施。完整的技术平台及专业的技术团队,保证了金开瑞不仅可以提供单一项目的技术服务,还可以提供miRNA,lncRNA,蛋白质组学相关等多种整合性项目服务。
“读”——对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的序列解读,定量、定位检测;
“解”——采用基因手段(干预、敲除或过表达)对预测的蛋白信息进行确证和深入分析;
“写”——通过体外重组方法制备,并通过系列实验确认其结构与功能尽可能的接近天然状态;
“用”——与客户合作讲蛋白的检测和合成领域的成果开发到市场需求标准的产品或平台。
六大技术平台:
蛋白质组分析平台——iTRAQ、SWATH、SILAC、Label-free,各种蛋白质组定量技术协助您发现信号转导通路关键蛋白、发现疾病标记物、发现药物靶标。
检测分析平台——通过免疫学分析方法(WB、IHC、IF、IP、ChIP、ELISA等),获得蛋白定量、定位等各种信息,确定您的目标蛋白。
基因服务平台——立足中心法则,围绕DNA/RNA/蛋白质开展全方位基因研究服务,合成&测序、载体构建、定点突变、qRT-PCR、RACE、CRISPR/Cas9……助您全面奠定蛋白研究基础。
病毒包装平台——13000种人源克隆库,各种功能载体,提供慢病毒、腺病毒、腺相关病毒包装及慢病毒稳转细胞株筛选服务,是您进行基因功能研究的绝佳助手。
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务,史上最全的六大表达系统,噬菌体展示技术,帮助您获得任意想要的蛋白。
抗体定制平台——单/多克隆抗体、人源化抗体、基因工程抗体、双特异性抗体、修饰抗体、诊断抗体、小分子抗体、抗体对……真正保证型应用型抗体定制,只有您想不到,没有我们做不到。

金开瑞坚持“以客户为中心”,专注于蛋白及相关研究,致力于做您最贴心的蛋白研究合作伙伴。


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