SWATH定量-金开瑞生物
蛋白质很少单独发挥作用,在所有生物功能中,蛋白复合体的功能占主导地位。在所有细胞中,蛋白质是最重要的组成部分,并且在大多数细胞功能中蛋白质间的相互作用是最基本的活动
SWATH定量方法确定蛋白复合体的成分是SWATH定量方法最常用的应用之一。
金开瑞借助高精度质谱平台,开发了一套从实验到生物信息分析的AP-SWATH流程,采用TAP技术将目标靶蛋白的相互作用蛋白特异性富集,然后结合具有高灵敏度、高准确度、高通量等特点的SWATH定量技术,能够高特异性的准确富集到靶蛋白的特异性相互作用蛋白,实现蛋白复合体的准确鉴定。
一、服务特色
技术特点
1、金开瑞是国内第一家提供SWATH定量蛋白质组技术服务的公司;
2、采用AP-SWATH技术,不需要过多的背景知识就可以得到大量含靶蛋白的复合体;
3、蛋白表达及与复合物的结合都接近生理水平;
4、采用两步亲和纯化,大大提高了纯化产物的特异性。
适用范围
TAP更倾向于高丰度和稳定的相互作用,许多低亲和力、瞬时和依赖特殊细胞环境的相互作用可能检测不到
特别适用于研究蛋白质在生理条件下的相互作用
一次实验只能检测一个蛋白的相互作用蛋白
二、服务说明
服务流程
接受订单及样品——亲和纯化产物——LC-MS/MS——数据解析——蛋白复合体确认——结果交付
客户提供
需鉴定的样品(胶粒/条带、液体、干粉);
样品要求:
1、样品含量:50-1000Fmol (根据检测项目而定)
2、胶类样品:银染过程中未使用戊二醛作为固定剂
3、保存方式:液体建议低温,胶类用去离子水防干
4、非胶样品要求:挥发性盐<20mM,无PBS、SDS和尿素等物质
样品信息单;需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息
最终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白复合体鉴定结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
1、根据参考谱图库解析SWATH谱图,鉴定肽段、蛋白,结果可靠性评估;
2、根据碎片离子的XICs进行相对定量,差异表达分析;
3、对鉴定到蛋白GO功能注释、Pathway代谢通路注释;
4、差异表达蛋白GO、Pathway功能富集分析;
5、主成分分析(PCA),发现差异蛋白质或者复合体成员。
三、服务周期及报价
服务周期
自送样起30个工作日。
服务报价
请询价。
如对蛋白复合体鉴定感兴趣或者需要技术支持,请您与我联系QQ:3013422302,或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/,可以搜索到您想要的服务信息,武汉金开瑞生物工程有限公司期待和您的合作。
武汉金开瑞生物工程有限公司位于武汉国家生物产业基地,是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。
关注蛋白整体研究思路,围绕蛋白的读、解、写、用,金开瑞建立起蛋白组、检测分析、基因服务、病毒包装、蛋白表达、抗体制备六大核心技术平台。所有平台的实验室及技术团队都坚持自主建设,各平台技术负责人都有5年以上相关领域的工作经验,可以最大程度的保障了项目按时保质的实施。完整的技术平台及专业的技术团队,保证了金开瑞不仅可以提供单一项目的技术服务,还可以提供miRNA,lncRNA,蛋白质组学相关等多种整合性项目服务。
“读”——对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的序列解读,定量、定位检测;
“解”——采用基因手段(干预、敲除或过表达)对预测的蛋白信息进行确证和深入分析;
“写”——通过体外重组方法制备,并通过系列实验确认其结构与功能尽可能的接近天然状态;
“用”——与客户合作讲蛋白的检测和合成领域的成果开发到市场需求标准的产品或平台。
六大技术平台:
蛋白质组分析平台——iTRAQ、SWATH、SILAC、Label-free,各种蛋白质组定量技术协助您发现信号转导通路关键蛋白、发现疾病标记物、发现药物靶标。
检测分析平台——通过免疫学分析方法(WB、IHC、IF、IP、ChIP、ELISA等),获得蛋白定量、定位等各种信息,确定您的目标蛋白。
基因服务平台——立足中心法则,围绕DNA/RNA/蛋白质开展全方位基因研究服务,合成&测序、载体构建、定点突变、qRT-PCR、RACE、CRISPR/Cas9……助您全面奠定蛋白研究基础。
病毒包装平台——13000种人源克隆库,各种功能载体,提供慢病毒、腺病毒、腺相关病毒包装及慢病毒稳转细胞株筛选服务,是您进行基因功能研究的绝佳助手。
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务,史上最全的六大表达系统,噬菌体展示技术,帮助您获得任意想要的蛋白。
抗体定制平台——单/多克隆抗体、人源化抗体、基因工程抗体、双特异性抗体、修饰抗体、诊断抗体、小分子抗体、抗体对……真正保证型应用型抗体定制,只有您想不到,没有我们做不到。
金开瑞坚持“以客户为中心”,专注于蛋白及相关研究,致力于做您最贴心的蛋白研究合作伙伴。
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