DNA甲基化芯片
概念和原理
DNA甲基化是表观遗传学的重要调控方式,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起到重要作用。
基因组DNA起声打断后,用重亚硫酸盐处理,全基因组扩增和酶切片断化后,与芯片上的等位基因特异性引物退火、杂交,用高解析度芯片扫描仪检测杂交信号。
科研和临床应用
l 全基因组范围内检测甲基化位点:
l 研究启动子甲基化对基因的调控;
l 比较不同细胞、组织、肿瘤的甲基化图谱:
l 寻找疾病诊断和预后的分子靶点。
标本采集、保存、运输
l 基因组DNA样品,样品要求:
a样品纯度:OD260/280值应在1.7-2.0之间;RIxIA应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染;
b样品浓度:浓度不低于55 ng/ul;
c样品总量:每个样品总量不少于5叫;
d样品溶剂:溶解在TE中;
e样品运输:DNA冷冻运输;在运输过程中请将管口密封好,以防出现污染;
l 组织样品:组织≥100 mg,-80℃保存,冷冻运输;
l 血液样品:全血≥1.0 ml,-80℃保存,冷冻运输;
l 细胞样品:细胞数≥106个,-800C保存,冷冻运输。
报告形式
l 实验文件:主要实验步骤、DNA质检报告;
l 实验图像:芯片扫描图:
l 实验数据:原始数据和处理的数据(甲基化总表、差异甲基化基因的功能分析、差异甲基化基因的pathway分析、Diffscore筛选、DeltaBeta筛选等)。
做实验,扫一扫
上海博舜生物科技有限公司
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