分子与细胞

基于Edman降解的蛋白质N端测序

基本信息
服务名称:
基于Edman降解的蛋白质N端测序
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总点击数:
2399
更新日期:
2023-11-16
服务类别:

服务详情

BTP-N端测序可以解决的生物学问题

蛋白表达产物的验证:重组蛋白插入位点和表达顺序是否正确;蛋白品质量控制;

细胞株建立和发酵过程中蛋白产物的验证:验证细胞株建立和发酵过程中蛋白产物N端甲硫氨酸和信号肽是否正确处理;

蛋白降解/酶切分析:对降解/酶切形成的新蛋白片段N端进行分析,确定断裂/酶切位点;

De-novo测序:对于蛋白数据库中不存在的全新蛋白序列进行分析。

百泰派克公司也建立了以先进的LC-MS/MS技术进行N-端测序的平台,可以测出封闭和修饰的蛋白质末端,与Edman降解法形成互补,保证N端测序服务的顺利进行。

关于样品

PVDF膜类样品的准备过程

1.样品电泳和电转

对蛋白样品进行1D或者2D跑胶

将蛋白胶上的样品转移至PVDF膜上;注意:千万不要使用硝酸纤维素膜(Nitrocellulose membranes)

在此过程中请佩戴手套和头套,避免自身角蛋白对测序结果的影响

2.PVDF膜的染色

染色过程中可以使用考马斯亮蓝或者立春红对PVDF膜进行染色;注意:千万不要使用银染的方法进行染色

染色完成之后,可以使用双蒸水对PVDF膜进行清洗

如果转膜的缓冲液中含有甘氨酸,需要对PVDF膜进行多次冲洗,以避免甘氨酸对后续分析的影响

更详细的样品准备步骤与,见Edman测序样品准备Protocol(下划线部分加入超链接)

3.靶蛋白条带获取

PVDF膜染色后,靶条带清晰可见,用洁净的解剖刀将靶蛋白条带切下

在蛋白量允许的情况下,可以准备2-3条靶条带以增加靶蛋白的量

4.样品运输

密闭包装后,冰袋运输即可

溶液样品的准备过程

1.蛋白的纯度和用量

样品纯度要>90%

Buffer中不要使用表面活性剂,并尽可能降低溶液的盐浓度

Tris, glycine, guanidine, glycerol, sucrose, ethanolamine, SDS, Triton, X-100, Tween和其他的去垢剂, ammonium sulfate 和其他的铵盐均会对后续的氨基酸鉴定产生影响,在样品准备过程中要避免使用

样品准备过程全程佩戴口罩和头套,避免角蛋白的影响

样品需要量在1-10ug

2.蛋白样品的运输

液体样品推荐干冰运输

液体样品也可以在冷冻抽干或者真空抽干后,冰袋运输

一站式服务

您只需下单-寄送样品

百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

表达纯化后的蛋白产物,特别是蛋白品的分析过程中,需要对蛋白的末端进行验证,以保证表达纯化产物的N端和C端序列准确。Edman降解法是蛋白的N端序列分析中非常成熟的方法之一,得到广泛应用。百泰派克公司采用岛津公司最新推出的 edman测序系统,为官大科研工作者和科研客户提供纯化后蛋白产物、蛋白品、抗体以及蛋白疫苗的N端测序服务。采用我们的测序系统,可以测定N端30个氨基酸的序列信息。采用特定的蛋白上样系统,我们最多可以测定N端的60-70个氨基酸。

如下图所示,每一个Edman测序循环包括3步:第一步是在碱性条件下,PITC与蛋白N端的游离氨基结合;第二步是在酸性溶液中,N端残基被切除;第三步是PITC结合的残基转化成为更为稳定的PTH残基,经过在线的HPLC分析,根据洗脱时间最终确定氨基酸种类。

Edman测序反应过程

蛋白样品首先进行SDS-PAGE的分离,保证样品的纯度满足测序的要求;随后将SDS-PAGE上的蛋白样品转移到PVDF膜上;经过染色确定把蛋白条带并切出;Edman测序仪对得到的PVDF膜上的蛋白样品进行分析。

Edman测序实验流程图

中/英文项目报告

在最终的技术报告中,百泰会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

1, 实验步骤(中英文)

2, 相关的质谱参数(中英文)

3, 鉴定的氨基酸的详细信息

4, 质谱图片

5, 原始数据

研究案例

如下图所示,通过Edman测序,可提供鉴定的氨基酸的详细信息。

公司简介
百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测项目验证
专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDAEMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001
双重质量体系认证
,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审
计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发药物申报注册生产放行
 
1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;
3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、
单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;
4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
5.服务3000+企业,10000+客户的选择;
6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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