芯片与生物信息学

分子对接

基本信息
服务名称:
分子对接
英文名称:
参考报价:
1
总点击数:
654
更新日期:
2018-08-13
服务类别:

服务详情

合研生物可以利用基于结构的药物设计方法,对可购买化合物、天然产物等数据库进行虚拟筛选,并获得潜在活性的化合物列表供进一步活性实验确证。面向制药企业和科研院所,可提供一站式的早期药物研发服务,包括虚拟药物筛选、先导优化、靶标预测、动力学模拟等,涉及化学药、生物药、中药等多种新药类型,为您提供优质的药物发现服务。

  • 计算机辅助药物设计

         计算机辅助药物设计(Computer-Aided Drug Design)是以量子力学和分子力学的分子模拟理论为基础,通过模拟、计算或模型学习,预测药物与靶标分子之间的作用,筛选、设计和优化先导化合物的方法。
       1. 基于结构的药物设计(Structure-based Drug Design, SBDD
            a) 分子对接(Molecular Docking)
            b) 从头设计(de novo)
            c) 药效团模型(pharmacophore)
       2. 蛋白结构的同源模建(Homology Modeling
       3. 动力学模拟(Molecular Dynamics
       4. 基于配基的药物设计(Fragment-based Drug Design, FBDD
            a) 定量构效关系分析(QSAR)
            b) 机器学习模型(Machine Learning)
            c) 构象分析(Conformational Analysis)
       5. 先导化合物优化(Lead Optimization
            a) 骨架跃迁(Scaffold Hopping)
            b) 生物电子等排体(Bioisostere)
            c) 分子相似性分析(Molecular Similarity Analysis)
            d) 成药性分析(Drug Profiler)
                理化性质(Physical and Chemical Properties)
                ADME性质(ADME Property)
               安全性(Safety Profiler)
       6. 多靶标药物设计(Multi-target Drug Design

  • 反向靶标预测

             寻找靶标的过程,称为反向找靶,即建立表型活性和分子靶标的关系。
              反向对接(Reverse Docking)
              反向药效团模型搜索(Pharmacophore Matching)
              配体分子相似性分析(Ligand Similarity Analysis)
              化合物-靶标网络(Compound-Target Network Plot)
              靶标作用通路富集分析(Pathway Enrichment Analysis)

  •  基于靶标的合理药物设计

         与疾病相关的生命科学基础研究或已有的药物成功研发案例可以发现并确证药物开发的靶标,此时,一个重要的任务是尽快发现多样性的活性化合物。如果靶标蛋白的结构已经通过X-Ray衍射或是NMR方法测定,可以利用基于结构的药物设计方法,包括分子对接、药效基团、从头设计、分子动力学等,对可购买化合物、天然产物等数据库进行虚拟筛选,并获得潜在活性的化合物列表供进一步活性实验确证。在靶标结构未知的情况下,盛世华康可以通过同源模建等方法建立该靶标的可能结构,并开展进一步的研究。
          基于配体的合理药物设计
          如果没有任何靶标结构相关的信息可以利用,可以根据已知的活性分子,根据相似性原理,开展定量构效关系分析、药效团模型构建、假想受体模型等研究,或进行先导化合物的结构优化,快速发现me too, me better的化合物。
         * ADME/T特性的理论评测
          可通过理论方法预测、分析客户所提供的苗头或先导化合物的吸收、分布、代谢、排泄以及毒性(ADME/T)特性,以帮助提高这些化合物的成药性。这些理论预测模型均基于大数据分析获得,既包括大量的商业模型,也包括基于独有技术开发的模型。
         表型活性的靶标预测
          对已经经过表型活性确认的分子,例如抗肿瘤、抗菌药物,通过反向分子对接、药效团搜索和机器学习算法推测该活性分子的潜在靶标,并进一步快速验证靶标的正确性。对分离或者合成获得的新颖化合物结构,可以通过上述技术,预测该化合物的潜在活性,实现靶标发现,提升化合物价值。


服务流程:
          客户提出需求-> 公司提供初步方案->双方协商方案细节与定价->公司提供药物设计结果->客户反馈->后续跟进服务

公司简介

合研生物医药科技有限公司是一家从事临床前技术服务的专业机构,致力于为全球药物研发用户提供优质高效的科研技术服务。公司位于国家级生物产业基地-武汉光谷生物城。为广大药物研发企业提供药物研发早期的多种服务,覆盖从计算机辅助药物设计、酶学靶点筛选、抗肿瘤药物活性评价、细胞功能学检测、药理病理学服务等各项技术,以及提供可购买的商业化合物库。公司与多家知名高校和科研院所的专家学者建立了紧密的合作关系,使公司在技术层面有了强力的支持与保障。携手合研生物,整合资源,节约成本,加速推进药物研发进程,加快成果产出。我们的愿景,国际一流的临床前技术服务机构;我们的使命,为全球客户提供最高效优质的临床前技术服务;我们的理念,以人为本,诚实守信,求真务实,绿色高效。

合研生物提供的服务包含但不限于以下:

酶学靶点筛选

      酶学研究一直是药物研发的重要组成部分。合研生物拥有丰富的酶学筛选经验,根据样本量的大小提供灵活的项目实施安排计划,可提供96孔和384孔两种板型的筛选模式,加速您的药物研发进程。酶学实验涵盖300多种筛选模型.

药物靶点开发与验证

       靶点研究细胞系的选择
       药物靶点筛选(shRNA,sgRNA文库筛选)
       药物靶点验证(shRNA,siRNA靶点敲除验证)

肿瘤细胞体外药效检测

        肿瘤组织分类及基因多样性覆盖面广泛,检测方法多样性。
        基于琥珀酸脱氢酶活性:MTT assay 
        基于其他氧化还原酶:CCK8 assay 
        基于ATP的检测:Cell Titer-Glo

体外筛选模型建立

       合研生物在药物筛选模型建立方面有着丰富的经验,实验项目负责人拥有多年为国外知名药企建立模型的经验。为药物早期研发中的高通量筛选和结构及效果研究(SAR)提供了模型基础。
       G蛋白偶联受体钙流检测
       G蛋白偶联受体cAMP检测
       离子通道检测
       报告基因检测

细胞系定制

        G蛋白偶联受体重组细胞系
        报告基因重组细胞系
        离子通道重组细胞系
        基因编辑细胞系

细胞功能学检测

       细胞增殖
       细胞毒性
       细胞迁移
       细胞凋亡
       细胞周期
       细胞第二信使检测如Ca2 ,cAMP,IP1

 

    高通量筛选

        G蛋白偶联受体高通量筛选
        离子通道高通量筛选
        激酶模型的化合物高通量筛选
        靶标特异性筛选

生志物分析
       合研生物能为药物研发企业提供全面的生物标志物分析,包括芯片扫描寻找生物标志物,DNA、RNA、蛋白水平对细胞及组织样本进行研究和检测,从而为药效检测提供依据。

       生物芯片:DNA芯片,mRNA芯片,miRNA芯片,Lnc RNA芯片,实时定量PCR芯片
       DNA水平:甲基化,SNP
       RNA水平:mRNA qPCR,miRNA qPCR
       蛋白水平:western blot,ELISA,免疫共沉淀,双向凝胶电泳
       细胞和组织水平:细胞流式学检测,免疫组化/免疫荧光

计算机辅助药物设计

面向制药企业和科研院所,合研生物可提供一站式的早期药物研发服务,包括虚拟筛选、先导优化、靶标预测、动力学模拟等,涉及化学药、生物药、中药等多种新药类型。

        计算机辅助药物设计
        反向靶标预测
        基于靶标的合理药物设计


售后服务
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武汉市东湖新技术开发区高新大道666号光谷生物城C1栋
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