分子与细胞

LC-MS mRNA碱基修饰检测

基本信息
服务名称:
LC-MS mRNA碱基修饰检测
英文名称:
LC-MS mRNA modification analysis service
参考报价:
总点击数:
565
更新日期:
2018-11-26
服务类别:

服务详情

mRNA化学修饰的定量检测是表观转录组学研究所必不可少的环节。检测不同处理条件下的表观转录修饰变化将为下一步的研究提供重要线索。Aksomics(原康成生物)的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的mRNA修饰谱。利用Agilent质谱仪,检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。

服务特色:

● 优化的前期处理与Agilent优质设备 

● 全面而准确的碱基修饰分析

 

分析流程:

图释:LC-MS mRNA修饰检测服务流程图。

分析种类:

Number Nucleoside Symbol Number Nucleoside Symbol
01 3′-O-methyladenosine 3′-OMeA 19 1-methylguanosine m1G
02 2′-O-methylcytidine Cm 20 7-methylguanosine m7G
03 5-methylcytidine m5C 21 N2-methylguanosine m2G
04 N6-isopentenyladenosine i6A 22 3′-O-methylinosine 3′-OMeI
05 5,2′-O-dimethylcytidine m5Cm 23 2-thiouridine s2U
06 1-methyladenosine m1A 24 4-thiouridine s4U
07 2-thiocytidine s2C 25 5-methyluridine m5U
08 N2,N2,7-trimethylguanosine m2,2,7G 26 N4-acetylcytidine ac4C
09 N4-acetyl-2′-O-methylcytidine ac4Cm 27 3′-O-methyluridine 3′-OMeU
10 N6-methyladenosine m6A 28 5-methyl-2-thiouridine m5s2U
11 3-methylcytidine m3C 29 5-methoxyuridine mo5U
12 3′-O-methylcytidine 3′-OMeC 30 pseudouridine Ψ
13 2′-O-methyladenosine Am 31 2′-O-methylinosine Im
14 N2,N2-dimethylguanosine m22G 32 3-methyluridine m3U
15 5′-O-methylthymidine 5′-OMeT 33 3′-O-methylguanosine 3′-OMeG
16 2′-O-methyluridine Um 34 1-methylpseudouridine m1Ψ
17 inosine I 35 5-hydroxymethylcytidine hm5C
18 2′-O-methylguanosine Gm 36 5,2′-O-dimethyluridine m5Um

 

结果展示

1. 修饰定量分析

图释:mRNA修饰数量分析图。

 

2. 总离子流程图

图释:总离子流程图

3. 不同离子对合并Peak图

       优化的前期处理与Agilent优质设备,确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。

图释:不同离子对合并Peak图。

 

 

公司简介



上海康成生物工程有限公司自2002年起专注于生物科研技术服务,是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。为进一步拓展在医学科研服务领域业务的深度和广度,向多谱领域发展,重塑品牌 Aksomics(数谱生物)Aksomics全面整合公司在非编码RNA(lncRNA、circRNA、small RNA等)、表观遗传学、蛋白组学等检测方向的核心技术,依靠自身优秀的研发、技术、营销和服务团队,凭借国际领先的技术平台和高标准的质控体系,形成了涵盖表观基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学等各个研究领域的一站式技术平台。

【表观基因组学】 DNA甲基化芯片、DNA羟甲基化芯片、染色质免疫共沉淀芯片、DNA甲基化测序、DNA羟甲基化测序、染色质免疫共沉淀测序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等

【转录组学】LncRNA芯片、LncPath™芯片、环状RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因组表达谱芯片、RNA测序、RNA m6A甲基化测序、small RNAs测序系列(microRNA测序、tRF&tiRNA测序、snoRNA测序、piRNA测序等)、LC-MS tRNA修饰检测、 nrStar™ ncRNA PCR芯片(tRF&tiRNA,tRNA,snoRNA,Functional LncRNA)、miRStar™癌症特异性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分类PCR芯片、LncRNA实时定量PCR、环状RNA实时定量PCR、tRF&tiRNA实时定量PCR、microRNA实时定量PCR、mRNA实时定量PCR

【蛋白组学平台】TMT标记定量蛋白组学服务、Lable-free定量蛋白组学服务、磷酸化修饰蛋白组学服务、泛素化修饰蛋白组学服务、N-糖基化修饰蛋白组学服务、乙酰化修饰蛋白组学服务、蛋白-蛋白相互作用组学

【代谢组学】靶向代谢组学、非靶向代谢组学

【外泌体组学】外泌体转录组学、外泌体蛋白质组学、外泌体代谢组学
康成生物为Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等国际知名品牌提供技术服务。康成客户采用各类技术服务发表的SCI论文已超560篇。康成生物将持续聚焦生命科学发展的挑战,提供有竞争力的产品和服务,持续为客户创造最大价值。

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