LC-MS mRNA碱基修饰检测
mRNA化学修饰的定量检测是表观转录组学研究所必不可少的环节。检测不同处理条件下的表观转录修饰变化将为下一步的研究提供重要线索。Aksomics(原康成生物)的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的mRNA修饰谱。利用Agilent质谱仪,检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。
服务特色:
● 优化的前期处理与Agilent优质设备
● 全面而准确的碱基修饰分析
分析流程:
图释:LC-MS mRNA修饰检测服务流程图。
分析种类:
Number | Nucleoside | Symbol | Number | Nucleoside | Symbol |
---|---|---|---|---|---|
01 | 3′-O-methyladenosine | 3′-OMeA | 19 | 1-methylguanosine | m1G |
02 | 2′-O-methylcytidine | Cm | 20 | 7-methylguanosine | m7G |
03 | 5-methylcytidine | m5C | 21 | N2-methylguanosine | m2G |
04 | N6-isopentenyladenosine | i6A | 22 | 3′-O-methylinosine | 3′-OMeI |
05 | 5,2′-O-dimethylcytidine | m5Cm | 23 | 2-thiouridine | s2U |
06 | 1-methyladenosine | m1A | 24 | 4-thiouridine | s4U |
07 | 2-thiocytidine | s2C | 25 | 5-methyluridine | m5U |
08 | N2,N2,7-trimethylguanosine | m2,2,7G | 26 | N4-acetylcytidine | ac4C |
09 | N4-acetyl-2′-O-methylcytidine | ac4Cm | 27 | 3′-O-methyluridine | 3′-OMeU |
10 | N6-methyladenosine | m6A | 28 | 5-methyl-2-thiouridine | m5s2U |
11 | 3-methylcytidine | m3C | 29 | 5-methoxyuridine | mo5U |
12 | 3′-O-methylcytidine | 3′-OMeC | 30 | pseudouridine | Ψ |
13 | 2′-O-methyladenosine | Am | 31 | 2′-O-methylinosine | Im |
14 | N2,N2-dimethylguanosine | m22G | 32 | 3-methyluridine | m3U |
15 | 5′-O-methylthymidine | 5′-OMeT | 33 | 3′-O-methylguanosine | 3′-OMeG |
16 | 2′-O-methyluridine | Um | 34 | 1-methylpseudouridine | m1Ψ |
17 | inosine | I | 35 | 5-hydroxymethylcytidine | hm5C |
18 | 2′-O-methylguanosine | Gm | 36 | 5,2′-O-dimethyluridine | m5Um |
结果展示
1. 修饰定量分析
图释:mRNA修饰数量分析图。
2. 总离子流程图
图释:总离子流程图
3. 不同离子对合并Peak图
优化的前期处理与Agilent优质设备,确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。
图释:不同离子对合并Peak图。
上海康成生物工程有限公司自2002年起专注于生物科研技术服务,是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。为进一步拓展在医学科研服务领域业务的深度和广度,向多谱领域发展,重塑品牌 Aksomics(数谱生物)。Aksomics全面整合公司在非编码RNA(lncRNA、circRNA、small RNA等)、表观遗传学、蛋白组学等检测方向的核心技术,依靠自身优秀的研发、技术、营销和服务团队,凭借国际领先的技术平台和高标准的质控体系,形成了涵盖表观基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学等各个研究领域的一站式技术平台。
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【代谢组学】靶向代谢组学、非靶向代谢组学
【外泌体组学】外泌体转录组学、外泌体蛋白质组学、外泌体代谢组学
康成生物为Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等国际知名品牌提供技术服务。康成客户采用各类技术服务发表的SCI论文已超560篇。康成生物将持续聚焦生命科学发展的挑战,提供有竞争力的产品和服务,持续为客户创造最大价值。
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