分子对接-云计算平台
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平台入口 平台概述
本平台是殷赋科技自主研发的生物医药云计算平台，集成并持续拓展丰富的专家解决方案，解决国内外院校与研发企业科研人员的计算难题。平台包含完善的综合方案和丰富实用的小工具，提供简明的操作教程，让计算专家和技术小白都能快速入门、各得所需。本平台所有计算任务均在云服务器进行，用户通过浏览器或微信小程序即可随时随地访问使用。
我们致力于打造一个丰富强大、灵活便利的生物医药云计算平台，欢迎各位用户朋友提出宝贵意见和建议，也欢迎有志之士加入我们的团队，助力科研社区。
1、按需购买，性价比高；
2、标准操作，智能提示，避免出错；
3、强大的开发团队和计算专家做后盾。
1、若不能正常显示分子结构，请将浏览器更新到最新版本！
2、在使用平台过程中遇到任何问题，请使用工单提交问题，我们会尽快协助您解决。
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如果本平台对您的研究工作有帮助，请在发表文章时引用平台（以及所用计算方案涉及的软件，详见计算方案简介下的“参考文献”）或致谢本公司。
引用范例：
The docking calculation was performed using Yinfo Cloud Computing Platform, a friendly and versatile web server for biomedicinal, material, and statistical researches (https://cloud.yinfotek.com).
致谢范例：
We thank Guangzhou Yinfo Information Technology Co., Ltd. for providing a friendly and versatile web server (https://cloud.yinfotek.com) to aid the docking studies.
1、计算方案
Dock6分子对接（结合模式预测）
– 简介
分子对接（molecular docking）是一种基于结构的药物设计方法，经常用于预测生物大分子与有机小分子的结合模式及亲和力。本计算方案采用UCSF DOCK 6.9软件作为分子对接引擎，实现了蛋白、多肽、核酸与有机小分子、短肽、核酸片断的分子对接功能。根据官方的测试数据和我们多年的使用经验，该方案的结合模式预测效果相当好，对接打分易于解释相互作用。我们推荐使用。
– 应用场景
生物大分子（蛋白、多肽、核酸）与有机小分子（或短肽、核酸片断）的结合模式与亲和力预测。
– 收费标准
普通：100元/个分子
套餐：敬请期待
– 教程
http://www.yinfotek.com/tutorials
– 参考文献
P. Therese Lang, Scott R. Brozell, Sudipto Mukherjee, Eric F. Pettersen, Elaine C. Meng, Veena Thomas, Robert C. Rizzo, David A. Case, Thomas L. James, and Irwin D. Kuntz. DOCK 6: Combining techniques to model RNA–small molecule complexes. RNA. 2009 Jun; 15(6): 1219–1230. doi: 10.1261/rna.1563609
Vina分子对接（结合模式预测）
– 简介
AutoDock Vina是一款最为流行的开源分子对接软件。本方案采用Vina 1.0程序作为分子对接引擎，经过拓展，针对蛋白、多肽、核酸与有机小分子，建立了完整便捷的分子对接流程。通常情况下，1小时内即可完成一篇分子对接文章所需的全部计算工作。
– 应用场景
生物大分子（蛋白、多肽、核酸）与有机小分子（或短肽、核酸片断）、主客体体系的结合模式与亲和力预测。
– 收费标准
普通：100元/个分子
套餐：敬请期待
– 教程
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– 参考文献
Oleg Trott and Arthur J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Comput Chem. 2010 Jan 30; 31(2): 455–461. doi: 10.1002/jcc.21334
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