circRNA测序
环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,测序采用Illumina测序平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析,环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。
基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的重要功能。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源circRNA测序项目,通过高效富集circRNA,借助最主流软件对circRNA进行鉴定,并通过分析来源基因,以深化对项目物种circRNA的功能研究。
了解更多>>分析内容 | 解决问题 |
参考序列比对 | 分析测序reads比对率和覆盖度 |
circRNA鉴定 | 发现样本中存在的circRNA |
circRNA来源基因分析 | 有助于明确哪些基因能够形成circRNA |
circRNA表达水平定量 | circRNA在各个样本中的表达水平 |
差异表达分析 | 样本之间差异表达的circRNA |
GO、KEGG富集分析 | 明确来源基因的具体生物学功能 |
miRNA结合位点预测 | circRNA发挥海绵效应的基础 |
环状RNA测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
至2015年12月,诺禾致源已经成功对人、鼠、羊、猪、鸡、斑马鱼、果蝇、家蚕、蜜蜂、线虫、拟南芥、油菜、水稻、棉花、稻瘟菌等30多个物种进行circRNA测序分析,做为一种相对较新的RNA测序产品,circRNA广受关注,大量研究成果发表在权威期刊。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。
作为目前国内基因测序领域的佼佼者,诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务,为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。
自成立以来,诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉,并建设有北京市工程实验室。
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