测序/合成

真菌基因组测序

基本信息
服务名称：
真菌基因组测序
英文名称：
参考报价：
服务商：
北京诺禾致源科技股份有限公司
总点击数：
1196
更新日期：
2020-10-16
服务类别：
测序/合成
服务详情
 无限未来的创造者————真菌基因组

真菌基因组研究，是通过基因组测序和组装获得真菌全基因组序列，并对其进行结构和功能研究的方法。依据研究目标所需精细程度的不同，我们提供了真菌框架图、精细图和作为真菌精细图前置的真菌Survey三种不同的解决方案。对这些菌株的深入研究，也让我们能够更好的了解和利用真菌资源，创造出更大的价值。

多样化基因组解决方案

多平台的选择，不同精细程度的真菌基因组测序方案，适用不同研究背景，为您量身定制最适宜的真菌基因组解决方案。

产品 测序平台 测序策略 组装指标 适用范围 项目周期
真菌Survey Illumina PE150 350bp文库 ≥ 100X 无 估算基因组大小
评估组装难度		 30个自然日
真菌框架图 Illumina PE150 350bp文库 ≥ 100X 无 大量菌株
框架测序		 45个自然日
真菌精细图 PacBio PacBio文库 ≥ 70X
350bp文库 ≥ 20X		 基因组<100 Mb
CN50*≥1 Mb;
基因组≥100 Mb
CN50*≥500 Kb		 少量个体
精细组装		 90个自然日
科学方案设计

从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
不同精细程度的真菌基因组信息分析，解密真菌的发展历程，探究其潜在价值。

研究领域 具体内容 作用
基因组组装 基因组组装及结果评估 组装获得高质量的基因组序列
基因组结构研究 编码基因预测 多种预测途径获得可靠编码基因信息
ncRNA预测 预测非编码RNA结构
重复序列分析 分析基因组重复序列结构
基因基本功能注释 常见功能数据库注释
(NR、GO、KOG、KEGG 、Pfam 、SwissProt、TCDB、CAZy)		 通过常见权威数据库解释编码基因功能
菌株致病相关研究 病原与宿主互作（PHI）、分泌蛋白、次级代谢产物基因簇、
细胞色素P450、真菌毒力因子（DFVF）		 从胞外分泌、宿主互作等机制解释菌株致病性
深入到位的数据挖掘

不论是个体深入变异解析，还是群体进化历史解读，我们都有完备的解决方案，为您解决关心的生物学问题。

研究目标 应用技术 解决问题
个体深入变异解析 基因组间共线性分析 基因组一对一共线性比较寻找基因组间同源序列
基因组间变异检测 以共线性区域为基础全面解析基因组间变异信息
群体进化历史解读 基因家族构建 基于MCL算法精准聚类单拷贝基因用于进化分析
进化树构建 构建菌株间进化关系解析菌株起源传播规律
悦读高质量测序数据，尽享HPC澎湃动力

真菌基因组测序采用先进的Illumina、PacBio测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合，实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展，高性能计算平台将会持续更新并扩容，以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

诺禾致源微生物客户遍布全球，截止2017年12月，已发表20余篇微生物文章，单菌完成样品数超过20000个，项目合作领域涵盖了动植物致病菌、工业菌、益生菌、环境菌株等广泛领域。
“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。

公司简介
北京诺禾致源科技股份有限公司于2011年3月在北京中关村生命科学园注册成立，专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用，致力于成为全球领先的基因科技产品和服务提供者。企业总部位于北京，在天津、南京、美国、英国和新加坡设有实验室或实验基地，并在香港、美国和英国设有子公司，办公面积逾40'000m2。目前，诺禾致源现已建立一支来自海内外顶级名校、多学科交叉型的高素质综合团队，其中硕士及其以上学历占比60%以上。公司建立了通量规模领先的基因测序平台和高性能计算平台，有效地支撑着生命科学研究和医疗健康两大领域对大数据分析和存储的需求。公司业务覆盖全球6大洲超过60个国家和地区，服务客户超过2,000家，成为基因测序科研服务领域的领先企业。诺禾致源在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系，完成多项具有国际先进水平的基因组学研究工作，截止2019年4月，诺禾致源与项目伙伴合作发表SCI文章总计429篇，累积影响因子大于2838；目前已取得软件著作权149项，专利22项；合作伙伴遍布全球，包括超过1920家科研院所和高校、720余家医院、1430余家医药和农业企业等。

作为目前国内基因测序领域的佼佼者，诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务，为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。

自成立以来，诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉，并建设有北京市工程实验室。

售后服务
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