测序/合成

解码蛋白与DNA结合的奥秘

基本信息
服务名称:
解码蛋白与DNA结合的奥秘
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449
更新日期:
2020-10-16
服务类别:

服务详情
 解码蛋白与DNA结合的奥秘

ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

平台优,周期短,性价比高。

用于在全基因组范围内研究蛋白特异结合的DNA片段,组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有助于洞悉蛋白对基因表达的调控以及染色体的功能结构。
具有“覆盖全,周期快,分析科学”的优势,已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源ChIP-seq测序项目,通过对IP下来的合格DNA样本,建库测序,获得高质量reads,根据SCC曲线判断IP效果,通过motif分析判断IP的特异性以及分析的可信性,高效预测相关基因,进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能,组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。

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分析内容 解决问题
测序数据质量评估 过滤掉低质量数据,保证数据质量
与参考基因组比对 scc分析,判断IP效果
peak峰calling 分析蛋白结合位点
motif分析 蛋白结合序列的偏好性
peak峰相关基因注释 寻找蛋白潜在调控基因
差异peak分析 分析不同样本间差异peak峰
相关基因功能分析 相关基因GO, KEGG富集分析
悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

ChIP-seq采用先进的HiSeq 2500测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2015年12月,诺禾致源项目涉及人、哺乳动物((猪、小鼠、大鼠)、斑马鱼、植物(水稻,拟南芥)、真核微生物(酵母,四膜虫)等30多种有参物种,样本数高达351个,助力客户发表多篇高水平文章。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

公司简介
北京诺禾致源科技股份有限公司于2011年3月在北京中关村生命科学园注册成立,专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用,致力于成为全球领先的基因科技产品和服务提供者。企业总部位于北京,在天津、南京、美国、英国和新加坡设有实验室或实验基地,并在香港、美国和英国设有子公司,办公面积逾40'000m2。目前,诺禾致源现已建立一支来自海内外顶级名校、多学科交叉型的高素质综合团队,其中硕士及其以上学历占比60%以上。公司建立了通量规模领先的基因测序平台和高性能计算平台,有效地支撑着生命科学研究和医疗健康两大领域对大数据分析和存储的需求。公司业务覆盖全球6大洲超过60个国家和地区,服务客户超过2,000家,成为基因测序科研服务领域的领先企业。诺禾致源在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系,完成多项具有国际先进水平的基因组学研究工作,截止2019年4月,诺禾致源与项目伙伴合作发表SCI文章总计429篇,累积影响因子大于2838;目前已取得软件著作权149项,专利22项;合作伙伴遍布全球,包括超过1920家科研院所和高校、720余家医院、1430余家医药和农业企业等。

作为目前国内基因测序领域的佼佼者,诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务,为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。

自成立以来,诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉,并建设有北京市工程实验室。


售后服务
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