测序/合成

Hi-C DNA三维空间捕获技术

基本信息
服务名称:
Hi-C DNA三维空间捕获技术
英文名称:
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总点击数:
419
更新日期:
2020-10-16
服务类别:

服务详情
 前沿技术带你走进DNA的三维空间

Hi-C技术是染色体构象捕获(Chromosome conformation capture,简称为3C)的一种衍生技术,是指基于高通量进行染色体构象的捕获,它能够在全基因组范围内捕捉不同基因座位之间的空间交互信息,研究三维空间中调控基因的DNA元件。

高通量染色体构象捕获技术

Hi-C技术是高通量染色体构象捕获技术
(High-throughput chromosome conformation capture)。
利用高通量测序技术,结合生物信息学分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,构建染色体跨度单体型,同时捕获不同基因座位上之间的空间交互信息,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
构建染色体跨度单体型,基于全基因组的互作信息,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。此外,还可结合转录组,重测序和ChIP-seq数据进行联合分析,从碱基变化、基因表达、蛋白修饰及染色体三维构象分析等多方面深入探讨生物学问题。

构建染色体跨度单体型 三维结构重构以及调控元件开发
测序质量评估
Hi-C数据质控比对统计
插入片段统计
NT库比对
比对参考基因组 比对及过滤
SNP检测与注释 互作图谱构建
InDel检测与注释 TAD分析
基因组杂合度统计 三维结构重构
染色体跨度单体型构建 调控元件的开发
悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

Hi-C技术采用先进的HiSeq PE150平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2017年12月,已经成功实现人、小鼠、大鼠、禽类、哺乳动物、鱼类、贝类、微生物类(真菌和原核生物)、拟南芥、水稻、玉米、大豆、棉花、小麦、油菜、花生、果树、林木、蔬菜等多种动植物的Hi-C测序和分析。
多样化的样本类型均可成功进行Hi-C文库构建,同时先进完善的实验流程和测序平台,保证优质的有效数据。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

公司简介
北京诺禾致源科技股份有限公司于2011年3月在北京中关村生命科学园注册成立,专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用,致力于成为全球领先的基因科技产品和服务提供者。企业总部位于北京,在天津、南京、美国、英国和新加坡设有实验室或实验基地,并在香港、美国和英国设有子公司,办公面积逾40'000m2。目前,诺禾致源现已建立一支来自海内外顶级名校、多学科交叉型的高素质综合团队,其中硕士及其以上学历占比60%以上。公司建立了通量规模领先的基因测序平台和高性能计算平台,有效地支撑着生命科学研究和医疗健康两大领域对大数据分析和存储的需求。公司业务覆盖全球6大洲超过60个国家和地区,服务客户超过2,000家,成为基因测序科研服务领域的领先企业。诺禾致源在全球范围内与众多学术机构建立了广泛的合作关系,完成多项具有国际先进水平的基因组学研究工作,截止2019年4月,诺禾致源与项目伙伴合作发表SCI文章总计429篇,累积影响因子大于2838;目前已取得软件著作权149项,专利22项;合作伙伴遍布全球,包括超过1920家科研院所和高校、720余家医院、1430余家医药和农业企业等。

作为目前国内基因测序领域的佼佼者,诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务,为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。

自成立以来,诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉,并建设有北京市工程实验室。


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