WGS全基因组脱靶检测
基于成熟的生物信息分析人才,专业的项目分析,可以根据客户不同要求分析个性化内容,在全集因组范围内对编辑位点和脱靶位点,进行精确的定位分析,并且针对于感兴趣片段进行准确定位。
从建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
1、客户需要提供给我们参考基因组序列信息;
2、编辑物种,编辑类型;
3、sgRNA序列信息;
4、编辑基因序列信息或插入片段序列。
脱靶检测 | 分析内容 |
基因敲除 | 基本信息分析部分 1.原始序列信息 2.测序数据质量评估 3.将原始序列与参考基因组进行比对分析,统计覆盖度,检测SNP/InDel 4.sg RNA 同源的序列区域进行筛选 筛选全部基因组区域内所有 sgRNA 同源区域,并根据同源分数进行排序 高级信息分析 5.sgRNA 同源区域脱靶检测 编辑前后样本序列信息比较,SNP、InDel进行分析,并且对 sgRNA 上下游100bp序列,做进一步分析,避免错失突变位点序列 6.PAM区扫描潜在脱靶位点 在 sgRNA 同源区域中,筛选 PAM区 NGG结构,例如 AGG,TGG,CGG,GGG,对 PAM区发生的SNP,InDel 情况进行统计 |
基因插入 | 基本分析 1. 数 据质控:去除含接头和低质量的数据 2. 与 参考基因组进行比对 3.统计测序深度及覆盖度 4. SNP/InDel 变异结果检测 高级分析 5.将插入序列mapping 到参考基因组中,确定插入具体位置 6.对插入位置或上下游基因进行功能注释 7.分析插入类型,杂合插入,纯合插入或者脱靶 8.分析同源序列插入情况 |
作为目前国内基因测序领域的佼佼者,诺禾致源的业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务,为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。
自成立以来,诺禾致源先后获得国家高新技术企业、北京市科技研究开发机构、北京市专利试点单位、北京市企业技术中心及国家发改委基因检测技术应用示范中心等多项资质与荣誉,并建设有北京市工程实验室。
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