测序/合成

单细胞测序分析

基本信息
服务名称:
单细胞测序分析
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931
更新日期:
2020-07-14
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服务详情
单细胞测序分析
服务简介
随着现代生物学的发展,以组织或细胞群体为研究对象,分析多种细胞的平均基因表达水平已经不能够满足科研需求。单细胞转录组测序是在单细胞水平对全转录组进行扩増与测序的一项新技术。10 x Genomics的Chromium Controller是基于流控技术的单细胞文库制备系统,可以同时获得100-80,00以上的单细胞,制备文库和Illumina平台兼容,通过测序实现对高通量单细胞数据进行细胞群体的分类以及细胞群体间基因表达的差异分析。10 Xgenomics单细胞表达分析可应用的细胞类型众多,如肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞、神经细胞、生殖细胞、胚胎细胞等。是研究肿瘤异质性,免疫细胞群体和胚胎发育的优秀方法。


t-SNE分析
tSNE:t分布领域嵌入算法,读作“Tee-Snee”,它只在用于已标记数据时才真正有意义,可以明确显示出输入的聚类状况。主要思想就是,将高维分布点的距离,用条件概率来表示相似性,同时低维分布的点也这样表示。只要二者的条件概率非常接近(用相对熵来训练,所以需要 label),那就说明高维分布的点已经映射到低维分布上了。


拟时间线分析
拟时( pseudotime)分析,又称细胞轨迹( cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频率较高。主要基于关键基因的表达模式,在拟时间对单个细胞进行排序,模拟出时间发育过程的动态变化。可以对所有细胞按分化拟时间进行细胞轨迹可视化,也可以对不同细胞亚群或样本进行可视化。



分析示意图
公司简介
广州竞远生物科技有限公司,是一家专业从事生物医药研究、产品研发和技术服务的高新技术企业。公司与包括中山大学及各附属医院、广州医科大学及各附属医院、广东省人民医院等在内的国内多家高校、医院建立了良好的合作关系。

公司拥有完善的分子生物学、细胞生物学和病理学等实验平台,团队成员中硕博士占比超过40%,科研团队成员来自中科院、上海交通大学、中山大学等国内顶尖科研单位,拥有丰富的科研经验,可为客户提供最佳的实验方案设计和专业的实验解决方案,帮助客户缩短科研周期、节约科研成本、提高科研效率。

中科院博士后带队生物信息学分析团队,专注于生物信息学数据的深入挖掘,贴合实验内容、研究方案向客户提供个性化分析内容,提高数据有效利用率。

竞远生物致力于协助客户完成生物及医学科研课题项目,是医学整体科研项目、生物医学科研转化的最佳服务商,更是您攀登科研高峰路上的最佳伙伴。

公司口号:助力开启医学科研新篇章!

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