芯片与生物信息学

土壤代谢组学

基本信息
服务名称:
土壤代谢组学
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501
更新日期:
2022-03-24
服务类别:

服务详情

土壤代谢组学(soilomics)是指用代谢组学的方法研究土壤中有机质及土壤微生物代谢含量变化及相互作用的一门科学。土壤微生物是土壤不可缺少的组成部分,是陆地生态系统中的分解者和调节者,能够参与生态系统的物质循环以及能量流动,其分布及活性揭示土壤的变化规律和演变趋势。研究土壤微生物碳代谢功能特征可以了解微生物多样性及其碳代谢能力,为探索调节、控制和改善土壤环境质量提供重要的参考。

 

技术优势

前处理经验丰富:能充分提取出土壤中的代谢物;
检测种类多:可检测土壤中多类代谢物。
 
技术路线
 

技术参数

样本要求
土壤样本      1-10 g/sampl
 
生物学重复
不低于6个生物学重复
 
检测平台
GC-TOF-MS(Agilent 7890B-LECO Peagsus HT/BT)
 
应用方向
1、土壤有机质及微生物成分分析;
2、土壤微生物代谢通路研究;
3、土壤生物多样性及功能;
4、污水土地处理系统代谢机制研究。
 
案例分析
      利用定量代谢组分析土壤代谢鉴定土壤基质
体外代谢组可以分析土壤细菌产生的低分子量有机物质的组成。本研究从腐殖质土壤中收集水溶性土壤微生物代谢物建立一种用非目标特征鉴定土壤基质的方法。用液相色谱质谱(LC/MS)和气相色谱质谱(GC/MS)鉴定到96种代谢物,代谢物定量信息可用于鉴别两种土壤基质(SDM)。这种方法也可以应用于鉴别不同特征的微生物群落。
 
参考文献
Jenkins S, Swenson T L, Lau R, et al. Construction of Viable Soil Defined Media Using Quantitative Metabolomics Analysis of Soil Metabolites[J]. Frontiers in Microbiology, 2017,8.
公司简介

公司介绍:上海百趣生物医学科技有限公司(简称百趣生物)成立于2013年4月,是一家专业提供生命科学前沿研究技术应用、咨询及开发的高新技术企业。百趣生物专注于创新质谱技术在生命科学研究与医学健康两大领域的应用,尤其在生命科学研究领域,公司在国内市场获得了优秀的口碑。自成立以来,百趣生物相继被认定为国家高新技术企业、高新技术成果转化项目、上海市科技型中小企业技术创新资金资助项目,百趣实验室相继取得了病原微生物实验室BSL-2备案、CMA认证。公司目前已经建立并完善的代谢组学平台,包括非靶标代谢组、高通量靶标代谢组、常规靶标代谢组、脂质组学、代谢流检测,同时建立了蛋白质组学平台,提供靶向及非靶向蛋白组学、修饰蛋白质组学、多肽组学等业务。

客服热线:400 664 9912 或 021-61531195

公司官网:www.biotree.cn
 


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