芯片与生物信息学

细胞核测序|单细胞核RNA测序

基本信息
服务名称:
细胞核测序|单细胞核RNA测序
英文名称:
snRNA-seq
参考报价:
伯豪生物 官网:http://www.shbio.com 询价热线 021-58955370
总点击数:
1116
更新日期:
2025-02-21
服务类别:

服务详情
单细胞核 RNA 测序

技术简介

伯豪生物官网 www.shbio.com 新消息 单细胞核转录组测序技术服务来了

伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

实验流程

伯豪生物单细胞核转录组测序科研流程图

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

冷冻样本和难消化样本的解决方案

1、适用于冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;

2、适用于难以制备单细胞悬液的组织样品;

3、减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;

4、不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

伯豪优势 

1、高质量抽核:抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;

2、标准化内控:丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;

3、流程化分析:完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;

4、专业的团队:专业的技术团队具有多年项目方案设计、实验操作、售后分析等经验;

5、全流程服务:提供组织抽核、单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

样本要求

1、组织用量:黄豆粒大小 1 块;

2、样本处理:组织液氮速冻,-80℃保存;

3、质量要求:组织 RNA 无降解,RIN≥7;

4、运输方式:干冰运输。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

应用领域

冷冻样本;通过消化难拿到高质量的单细胞悬液的组织类型。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

研究成果

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 1

小鼠肝脏单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 2

 

人松果体单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 3

 

小鼠大脑皮层单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 4

小鼠心脏组织细胞核 RNA 质检(RIN=8.9)

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 5

PCR 验证组织与细胞核、组织与消化细胞的差别(0 为相同)

结论:

小鼠大脑皮层,相比于消化细胞,细胞核的表达情况更接近于原始组织样本。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比

1、随着测序深度的不断增加,单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)得到的基因数相近。

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 6

Single-cell DropSeq scDropSeq

 

2、单细胞核转录组测序在细胞分群上与单细胞转录组测序没有区别

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 7

单细胞核数据分群结果                                     单细胞转录组数据分群结果

3、单细胞核转录组测序可有效挖掘稀有细胞类型

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 8

单细胞核转录组测序可以减少组织消化引起的偏差

 

4、单细胞核转录组测序结果中发现较少压力相关基因的表达

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 9

参考文献

[1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita, et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

[2] Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.

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伯豪生物客户项目发文
序号 伯豪生物提供服务 杂志 IF 发表年份 研究方向
1 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】纹状体组织
【原文链接】点击查看
Advanced Science 14.3 2024年 疾病机制
2 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】脑组织
【原文链接】点击查看
PNAS 9.4 2024年 疾病机制
3 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】右心室组织
【原文链接】点击查看
Journal of Translational Medicine 6.1 2024年 疾病机制
4 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】骨转移样本组织
【原文链接】点击查看
Cell Reports 7.5 2024年 疾病机制
5 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】骨软组织
【原文链接】点击查看
Theranostics 12.4 2024年 疾病机制
6 【服务】单细胞核转录组测序
【样本】大脑组织
【原文链接】点击查看
Advanced Science 15.1 2024年 疾病机制
7 ......
 
公司简介

伯豪生物园区

 

伯豪生物企业文化茁壮生长

 

上海伯豪生物技术有限公司(简称:伯豪生物,英文名:Shanghai Biotechnology Corporation)2008 年 12 月成立,是生物芯片国家工程研究中心的有机组成部分,专注于提供专业的生物医药和疾病诊断创新技术、产品和优质服务。

 

伯豪生物 CRO 服务内容

 

伯豪生物自成立以来获得了国家基因检测技术应用示范中心、国家工信部专精特新“小巨人”企业、院士专家工作站、高新技术企业、上海市研发公共服务平台(负责“上海市高通量疾病标志物服务平台”和“上海市基因芯片专业服务平台”的运营)、上海市服务外包公共平台、上海科技小巨人企业、浦东新区企业研发机构、联合实验室建设等一系列资质,拥有医疗机构执业许可证、医疗器械经营许可证。

 

伯豪生物历年荣誉证书

 

伯豪生物于 2016 年入选国家发展和改革委员会首批基因检测技术应用示范中心,与复旦大学附属肿瘤医院、上海市胸科医院、上海市儿童医院、上海生物信息技术研究中心等单位共同承担运行“高发肿瘤及遗传性疾病基因检测示范中心”。

 

伯豪生物获得 IOS9001 质量服务体系认证

 

伯豪生物建立了规范化的质量控制体系,通过了 ISO9001:2015 质量技术体系的认证,并参照 GLP- L 的标准,通过 156 个 SOP 文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。

 

伯豪生物协助客户发表文章数据

 

伯豪生物累计技术服务 10 余年,承接项目数超 10000 个,用户单位 3000 家以上,累计处理样品超过 30 万份,协助客户发表论文 2000 余篇,总影响因子(IF)超 10000 分,平均影响因子(IF)大于 5 分。全面推动中国基因组学服务产业发展。可靠的质量已经得到了国内及国际科研领域的认可!伯豪生物秉承着“服务科技创新,护航人类健康!”的使命,为每一位伯豪生物客户提供专注、专业、高效的科研技术服务。

 

伯豪生物经过十多年不断投入和持续打造,伯豪生物已经成长为一家硬件精良,人才合理,技术专业,管理规范,理念先进,符合国际标准的以技术开发和技术服务见长的生物技术公司。

 

伯豪生物营销网络
 

经营范围
       生物芯片、实验室试剂及相关设备的研发、生产、销售,生物医药技术专业领域的技术服务、技术转让、技术咨询,从事货物与技术的进出口。 【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】。
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转录组
表观组
蛋白质组学
生信分析
仪器试剂耗材

售后服务
上海伯豪生物技术有限公司(简称“伯豪生物”) 客服热线:021-58955370 企业微信:177-0213-9967 公司地址:上海市浦东新区张江镇李冰路151号 公司官网:https://www.shbio.com 服务内容:科研CRO服务(生命科学分子实验),科研试剂(品牌:Agilent、BioYou、Tobitec等) 售后标准:遵循ISO9001:2015国际质量标准。
联系方式
单位名称:
详细地址:
浦东新区张江高科技园区李冰路151号
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316778748
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