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iTRAQ/TMT 相对定量蛋白质组

基本信息
服务名称:
iTRAQ/TMT 相对定量蛋白质组
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总点击数:
409
更新日期:
2025-05-14
服务类别:

服务详情
利用质谱仪开展的蛋白组学研究中,质谱的扫描速度会影响蛋白的鉴定深度。引入双TIMS/PASEF®ᅠ(Parallel Accumulation - SErial Fragmentation平行累积串行碎裂)分离技术的timsTOFᅠPro平台使得蛋白质组学进入了4D蛋白质组学新时代。传统的3D分离技术包括保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity),4D分离技术增加了第四个维度—离子淌度(mobility),进而大幅度的提高了扫描速度和检测灵敏度,大幅提升蛋白鉴定的数量和覆盖率。 

timsTOFᅠPro创新性地使用了双TIMS分离/富集装置,离子在第一个TIMS部分中进行累积,在第二个TIMS中根据淌度进行分离,经过分离后的离子继续用于MS/MS碎裂。往复进行此过程,当第二个TIMS进行分离时,第一个TIMS也同时在平行地累积离子,这样可以实现近乎100%的离子利用率,减少1价离子(杂离子)的干扰。

iTRAQ/TMTᅠ蛋白定量,是通过体外同位素标记方法,对蛋白酶解后的肽段进行标记,从而对多个样品的蛋白质进行相对定量分析。每种标记都包含报告基团、质量平衡基团和多肽反应基团,三种基团分子量之和相等,使得不同样品的相同类型肽段的质荷比相同。在经过二级质谱时,质量平衡基团丢失,报告基团会产生不同的报告离子。通过检测该离子的信号强度即可得到不同样品间同一肽段的定量信息。与非标记定量技术相比,标记定量的灵敏度更高,可重复性好。


实验流程  

蛋白提取、质检 ——> 蛋白酶解 ——> 标签标记 ——> LC-MS/MS上机 ——> 原始数据质控、分析

样品要求  
// 细胞:5×106个细胞;
// 动物组织:200mg;
// 植物组织:800mg;
// 微生物:400mg;
// 血清血浆:300μl

公司简介
       上海生物芯片有限公司成立于2001年8月,公司由上海科技创业投资(集团)有限公司、上海张江(集团)有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成,经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”,是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一,是全国生物样本标准化技术委员会(TC559)、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会(BBCMBA)与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。

       通过二十余年的建设和发展,公司(中心)确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系,以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系,形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务,公司(中心)具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。

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