全转录组
基本信息
服务名称：
全转录组
英文名称：
Whole transcriptome
参考报价：
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服务商：
总点击数：
201
更新日期：
2023-04-23
服务类别：
服务详情
全转录组（Whole transcriptome），是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和，基于二代测序平台，采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法，实现编码RNA和非编码RNA（miRNA, lncRNA, circRNA）的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等，研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用，深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
数据分析
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
- 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
- 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
- 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
- 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
数据分析
| 基础分析 | 互作网络分析 |
| 数据质控 | 靶基因分析 |
| 参考基因组比对 | ceRNA调控网络 |
| RNAs鉴定和预测 | 蛋白互作网络 |
| 表达及差异表达分析 |
技术优势
参考文献
1.Linjun, Hong, Ting, et al. Genome-Wide Analysis of Circular RNAs Mediated ceRNA Regulation in Porcine Embryonic Muscle Development.[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2019, 7:289-289.
2.Guoqiang F, Zhe W, Xiaoqiao Z, et al. ceRNA Cross-Talk in Paulownia Witches' Broom Disease[J]. International journal of molecular sciences, 2019.
- 数据丰富：一份样本可同时获得4种RNA（miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA）的信息；
- 全面的关联分析：可以进行两两间关联分析和两者以上ceRNA网络调控分析，不仅可以解释生物学现象背后的网络调控机制，而且有助于缩小筛选范围，挖掘关键基因。
参考文献
1.Linjun, Hong, Ting, et al. Genome-Wide Analysis of Circular RNAs Mediated ceRNA Regulation in Porcine Embryonic Muscle Development.[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2019, 7:289-289.
2.Guoqiang F, Zhe W, Xiaoqiao Z, et al. ceRNA Cross-Talk in Paulownia Witches' Broom Disease[J]. International journal of molecular sciences, 2019.
公司简介
中科新生命（APTBIO）自2004年成立以来，已建立科技服务（蛋白/修饰/代谢研究）、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部，是最早参与国际HLPP（肝脏）、HPPP（血浆）项目的平台之一，已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者，中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇；获得各项发明专利和专业著作权数十项；并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统（LIMS），强化了实验室质量监测和质量管理，保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念，整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据，为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。
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