真核无参转录组测序
服务详情
基于Illumina 测序平台，真核无参转录组测序采用Illumina Hiseq平台，对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序，拼接出最长的转录本为unigene，以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释，全面分析基因表达水平和结构信息。
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
▶ 质控严格：严格的质量控制，及时与客户沟通RNA质检结果
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，建库成功率＞98%，数据质量高，Q30＞85%
▶ 分析内容丰富：个性化分析，联合分析，分析内容更丰富
参考文献
1.Prediction of a peptidome for the ecotoxicological model Hyalella azteca (Crustacea; Amphipoda) using a de novo assembled transcriptome. Mar Genomics. 2018
无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析，为生态毒理研究奠定良好的基础。
2.De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017
无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析，更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。
实验流程
应用方向
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
数据分析
| 转录本拼接组装 | 基因表达水平定量 |
| 基因功能注释（7大数据库） | 样品间相关性分析 |
| CDS预测 | 基因差异表达分析 |
| SNP分析、Indel分析 | 差异表达基因功能富集分析 |
| SSR分析 | 差异表达基因的蛋白质互作网络分析 |
| 转录因子注释 | 个性化分析 |
技术优势
▶ 样品类型广泛：动植物组织、微生物、细胞、外泌体等▶ 质控严格：严格的质量控制，及时与客户沟通RNA质检结果
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，建库成功率＞98%，数据质量高，Q30＞85%
▶ 分析内容丰富：个性化分析，联合分析，分析内容更丰富
参考文献
无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析，为生态毒理研究奠定良好的基础。
2.De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017
无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析，更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。
公司简介
中科新生命（APTBIO）自2004年成立以来，已建立科技服务（蛋白/修饰/代谢研究）、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部，是最早参与国际HLPP（肝脏）、HPPP（血浆）项目的平台之一，已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者，中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇；获得各项发明专利和专业著作权数十项；并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统（LIMS），强化了实验室质量监测和质量管理，保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念，整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据，为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。
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