分子与细胞

4D-DIA定量蛋白质组学

基本信息
服务名称:
4D-DIA定量蛋白质组学
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148
更新日期:
2023-04-23
服务类别:

服务详情
4D-蛋白质组学是基于timsTOF Pro质谱仪,通过捕集离子淌度(TIMS)与同步累积连续碎裂(PASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离(保留时间、质荷比、离子强度)基础上,增加肽段的碰撞截面积(CCS),实现第4维度(离子淌度)的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的DIA技术,通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂(diaPASEF)扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合,具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时,外加第四维离子淌度分离,使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时,降低谱图复杂度和提高离子利用率,实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程
 
 
应用方向
▶ 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析
▶ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究
▶ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析
▶ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选
▶ 各种物种的蛋白质组草图构建

数据分析
 
 
技术优势
▶ 4D技术加持,更加适合微量样本
▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制,灵活方便
▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台,检测速度提升近一倍
 
推荐组合产品
大分子专属平台,质量与效率双重保障:4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白质组
 
参考文献
1.Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.
4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染机制
2.diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.
4D-DIA技术原理介绍:diaPASEF
公司简介
中科新生命(APTBIO)自2004年成立以来,已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部,是最早参与国际HLPP(肝脏)、HPPP(血浆)项目的平台之一,已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者,中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇;获得各项发明专利和专业著作权数十项;并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统(LIMS),强化了实验室质量监测和质量管理,保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念,整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据,为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。

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