蛋白质组与转录组联合分析
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转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具，从生物学角度上看，转录组代表了基因表达的中间状态，可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理；而蛋白质是生物体直接的功能执行者，因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制，精确研究重要基因的表达模式和调控机理，只有联合转录组学和蛋白组学表达量数据对生物样本进行系统研究，才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性，进而从整体上解释生物学问题。
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
▶ 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
▶ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
▶ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；
▶ 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
▶ 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
▶ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
▶ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；
▶ 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。
数据分析
| 类型 | 内容 |
|---|---|
| 表达关联分析 | 关联数量统计 |
| 表达量相关性分析 | |
| 表达量聚类分析 | |
| 关联结果功能注释与富集分析 | GO关联分析 |
| KEGG关联分析 |
▶ 构建蛋白质数据库，大幅度提高蛋白质鉴定数量；
▶ 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”；
▶ 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制；
▶ 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证；
▶ 精准医疗：实现genomics到protegenomics的转变。
▶ 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”；
▶ 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制；
▶ 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证；
▶ 精准医疗：实现genomics到protegenomics的转变。
参考文献
1.Systems-level identification of PKA-dependent signaling in epithelial cells. PNAS. 2017.
2.Proteogenomic integration reveals therapeutic targets in breast cancer xenografts. Nat Commun. 2016.
公司简介
中科新生命（APTBIO）自2004年成立以来，已建立科技服务（蛋白/修饰/代谢研究）、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部，是最早参与国际HLPP（肝脏）、HPPP（血浆）项目的平台之一，已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者，中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇；获得各项发明专利和专业著作权数十项；并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统（LIMS），强化了实验室质量监测和质量管理，保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念，整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据，为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。
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