分子与细胞

植物（次生）代谢组

基本信息
服务名称：
植物（次生）代谢组
英文名称：
参考报价：
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服务商：
上海中科新生命生物科技有限公司
总点击数：
199
更新日期：
2023-04-23
服务类别：
分子与细胞
服务详情
次生代谢产物（Secondary metabolites）是不直接涉及到生命正常生长、发育或繁殖的有机化合物，次生代谢产物在植物中起着重要的作用，与抵御病虫害及应对环境胁迫密切相关。次生代谢产物主要包含：生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等。部分次级代谢产物可以作为药物、调味品或药物。本方法利用基于高分辨质谱的LC-MS非靶向代谢组技术，建立了庞大的初级代谢物和次生代谢物的数据库，通过“MS1+MS2+RT”或“MS1+MS2”的方式辅助人工谱图解析对代谢物进行鉴定，助力植物代谢组学研究。
 
实验流程
 
 
送样建议
样本类型 常规送样量 最低送样量 建议生物学重复
植物组织 ≥400 mg ≥200 mg 重复数≥６
水培分泌物 ≥10 mL（可自行提前冷冻浓缩） ≥5 mL（可自行提前冷冻浓缩）
其他样本 请另外咨询
备注：根系分泌物等类似样本因为代谢物浓度低，客户可自行取等量体积冻干之后寄送给我们，以便得到更好的实验结果
 
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
▶ 植物次生代谢物活性成分鉴定
▶ 植物抗病虫害、抗逆研究
 
数据分析
分析类型 分析内容
质控 TIC、QC等多项
差异分析 单变量统计分析（火山图等）
多维统计分析（PCA、PLSDA、OPLSDA）等
功能分析 层次聚类分析
相关性分析
KEGG分析
高级生信分析 回归分析
趋势聚类分析
 
技术优势
▶ 实测定性数目多：均定性数目在800+
▶ 物质种类多：包含生物碱、黄酮类、萜类、糖苷类等众多次级代谢物和初级代谢产物
▶ 鉴定准确：QE高分辨质谱，严格谱图匹配标准（MS1，MS2，RT，人工谱图解析）
▶ 严格质控：多项严格QC系统，保证定性定量结果最优
 
参考文献
1.Identification and Mode of Inheritance of Quantitative Trait Loci for Secondary Metabolite Abundance in Tomato. Plant Cell. 2015.
植物次生代谢组-番茄-番茄次生代谢产物和性状位点的鉴定及遗传模式研究
2.Primary transcript of miR858 encodes regulatory peptide and controls flavonoid biosynthesis and development in Arabidopsis. Nature Plants. 2020.
植物次生代谢组-拟南芥- miR858的初级转录物编码调控肽控制拟南芥类黄酮的合成
公司简介
中科新生命（APTBIO）自2004年成立以来，已建立科技服务（蛋白/修饰/代谢研究）、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部，是最早参与国际HLPP（肝脏）、HPPP（血浆）项目的平台之一，已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者，中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇；获得各项发明专利和专业著作权数十项；并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统（LIMS），强化了实验室质量监测和质量管理，保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念，整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据，为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。
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