土壤代谢组
服务详情
土壤中的代谢物主要来自于植物根际分泌物及微生物对有机质的降解。土壤微生物的代谢活动对生物残体的分解、土壤结构形成、有机物转化、有毒物质的降解等过程有至关重要的作用。另一方面也有研究表明，植物根际分泌物可以调节与根际微生物的互作关系。对土壤中的代谢物进行检测分析，对于土壤菌落功能、环境毒理、植物环境互作、土壤质量评价等方向研究具有重要意义。
产品定义
利用基于LC-MS的非靶向代谢组学方法对土壤中的代谢物进行定性和相对定量分析。
2.Li X , Song Y , Bian Y , et al. Insights into the mechanisms underlying efficient Rhizodegradation of PAHs in biochar-amended soil: From microbial communities to soil metabolomics[J]. Environment International, 2020, 144:105995.
3.Li X , Qu C , Bian Y , et al. New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme activity and sequencing analysis with metabolomics[J]. Environmental Pollution, 2019, 255:113312.
产品定义
利用基于LC-MS的非靶向代谢组学方法对土壤中的代谢物进行定性和相对定量分析。
实验流程
数据分析
| 分析类型 | 分析内容 |
| 质控 | TIC、QC等多项 |
| 轮廓分析 | Superclass分类 |
| 差异分析 | 单变量统计分析（火山图等） |
| 多维统计分析（PCA、PLSDA、OPLSDA）等 | |
| 功能分析 | 层次聚类分析 |
| 相关性分析 | |
| KEGG分析 | |
| 高级生信分析 | WGCNA分析 |
| 回归分析 | |
| 趋势聚类分析 | |
| 机器学习 |
参考文献
1.Song Y , Li X , Yao S , et al. Correlations between soil metabolomics and bacterial community structures in the pepper rhizosphere under plastic greenhouse cultivation[J]. Science of The Total Environment, 2020, 728:138439.2.Li X , Song Y , Bian Y , et al. Insights into the mechanisms underlying efficient Rhizodegradation of PAHs in biochar-amended soil: From microbial communities to soil metabolomics[J]. Environment International, 2020, 144:105995.
3.Li X , Qu C , Bian Y , et al. New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme activity and sequencing analysis with metabolomics[J]. Environmental Pollution, 2019, 255:113312.
公司简介
中科新生命（APTBIO）自2004年成立以来，已建立科技服务（蛋白/修饰/代谢研究）、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。APTBIO前身为原中国科学院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心对外服务部，是最早参与国际HLPP（肝脏）、HPPP（血浆）项目的平台之一，已获得CMA计量认证,邓白氏认证及ISO9001质量认证。作为国内提供质谱系统解决方案的领航者，中科新生命已在高水平SCI杂志上发表论文数百篇；获得各项发明专利和专业著作权数十项；并建立具有自主知识产权的实验室信息管理系统（LIMS），强化了实验室质量监测和质量管理，保证客户数据的高效安全性。APTBIO秉承“为人类健康事业做出贡献”的信念，整合蛋白质组、代谢组、临床诊疗及医药研发数据，为实现基础研究到临床的完美转化提供精准平台。
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