DNA亲和纯化测序（DAP-seq）
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)
高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点
在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(transcription factor binding sites,TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS,然而,好抗体可遇而不可求,而且植物种类抗体本就不够齐全,这在很大程度上限制了ChIP-seq技术更广泛的应用。
2016年,O'Mally RC 等人在Cell上发表了使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术,快速绘制转录因子调控靶向DNA区域图谱的文章。2017年,Bartlett A 等人在Nature Protocol上发表了DAP-seq的实验方法。
DAP-seq技术的出现,使TFBS的研究不再局限于物种,不再受抗体质量的限制,为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具,特别是植物方面的研究。
我司可为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析,目前,我们已有40多个物种,200多个转录因子的实战经验。
已做物种:拟南芥、烟草、水稻、小麦、玉米、大豆、棉花(陆地棉)、苜蓿、高粱、大麦草、百脉根、黄瓜、菜心、荔枝、香蕉、葡萄、苹果、柑橘、甜橙、桃、甜瓜、甘蔗、樱桃、芍药、枣、核桃、毛果杨、胡杨、油松、毛白杨、大青杨、白桦、光皮桦、欧洲云杉、柳、麻风树、金银花、丹参、木薯、地钱、飞蝗 等。
已做转录因子(部分):bHLH、BES1、GATA、ARF、ERF、bZIP、C2H2、GRAS、DREB、EIN3、WRKY、AP2、NAC、TCP、G2-like、HD-Zip、MADS、MYB、BZP、NFY、RAV、SPL、WOX、CAMTA、BZR、SBP、Co-like、Dof 等。
相关技术服务
1. 凝胶阻滞实验(EMSA)：DAP-seq后续验证服务。
2. DAP-seq与RNA-seq联合分析:分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。
3. DNA pull down:鉴定与DNA结合的蛋白。
4. 精美的论文图片设计与制作,提升论文的严谨性和美观度。
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