测序/合成

长链非编码 RNA 测序

基本信息
服务名称:
长链非编码 RNA 测序
英文名称:
参考报价:
总点击数:
229
更新日期:
2022-10-14
服务类别:

服务详情
  LncRNA高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法,对长链非编码 RNA、mRNA 、环状RNA等大RNA进行测序研究,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程(例如发育、疾病等)所有大RNA转录本数据信息,可应用于细胞分化和发育的研究、调控机理的研究、疾病标志物的寻找、疾病的分子诊断、基因药物的研发等。                                                                           

产品优势

1.  超高的技术稳定性

同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993;

2.  丰富的项目经验

已完成万例lncRNA项目,涉及人鼠及动植物物种;

3.  精湛的技术工艺

可承接人、鼠、动植物样品,外泌体、FFPE等,样品起始量低至20ng;

4.  Dr.Tom多组学数据挖掘系统交付,分析无忧

一次测序即可获得mRNA、lncRNA、circRNA及关联数据分析结果;

10大数据库注释,多维度结果图片展示,数据图表循环挖掘;

ceRNA、蛋白、共表达、关键驱动基因互作网络分析可视化;

系统随时更新文献信息,查基因得文献,便于文章撰写;

5.  严格的质量管理

实验全程采用全方位质控体系,应用质量管理体系金标准;

6.  贴心的售后支持

7*24小时全天候技术支持,快速响应客户需求。

产品应用

1. 细胞分化和发育调控机理的研究

2. 疾病标志物的寻找

3. 疾病的分子诊断

4. 基因药物的研发

信息分析内容

标准信息分析(circRNA仅限人、小鼠)

1、基本数据统计

① 去除接头序列、低质量序列得到reads信息

② 样品相关性

③ 表达量分布

④ RNA分类

2、参考基因组比对

3、lncRNA、mRNA、circRNA鉴定

4、lncRNA、mRNA、circRNA定量分析

5、lncRNA、mRNA、circRNA差异表达分析(样本间、组间)

6、lncRNA、mRNA、circRNA表达/差异基因聚类

7、mRNA差异基因GO分类、富集

8、mRNA差异基因KEGG分类、富集

9、mRNA结构分析

① 可变剪切分析

② 融合基因分析(仅限人)

高级信息分析

一)数据库注释

1、转录因子注释(AnimalTFDB/PlantTFDB)

2、GSEA分析

3、Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释

二)互作网络分析

1、  靶基因分析

① miRNA-mRNA靶向关系分析

② lncRNA-mRNA靶向关系分析

2、  ceRNA互作网络分析

3、  蛋白互作网络分析

4、  共表达互作网络分析

三)特色分析

1、外部数据库关联分析(TCGA、ARCHS4)

2、关键驱动基因网络图分析

3、时间序列分析

公司简介
华大科技于2012年完成整合,致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商,为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前,公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区,拥有7,000多位合作单位,为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务,更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上,截至2020年9月底,公司累计参与发表近1,500篇文章,其中CNNS 120+。截止2022年3月,华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章,影响因子合计8,800+,并实现CNS三大主刊发文。

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