QPCR
1、RNA提取 对于贴壁细胞样本 (1)用移液器小心吸去培养基,加入1mL 4℃预冷的PBS溶液,小心摇晃洗去残余培养基,用移液器吸尽PBS溶液,加入1mL Trizol溶液,反复吹打培养瓶/培养基底部及四周,将细胞充分吹打到Trizol中。加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。 (2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。 (3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。 对于悬浮细胞样本 (1)低速离心收集细胞,加入适当体积的冷却的PBS缓冲液重悬,300g离心10 min,吸除上清。重复以上操作两次,收集细胞沉淀。加入1mL Trizol溶液,反复吹打将细胞充分吹打到Trizol中加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。 (2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。 (3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。 对于组织样本 (1)标本于-80℃或液氮中保存,用已经消毒的工具于冰上取约100mg组织,于1mL 预冷的Trizol中充分研磨,匀浆液小心倒入1.5mL EP管中,加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。 (2)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL 于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。 (3)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。 对于血液样本 (1)取500μL全血于15mL离心管中,加入10倍体积红细胞裂解液,混匀,室温避光静置10min。 (2)室温,300g,离心10min,弃上清,重复步骤(1),室温,300g,离心10min,弃上清。 (3)PBS重悬细胞沉淀,室温,300g,离心10min,弃上清,100μL PBS重悬细胞,加入1mL Trizol,混匀,静置5min,加入250μL三氯甲烷,充分混匀,冰上静置5min。 (4)混合液4℃,10000g,10min离心。超净工作台中小心吸取上清500μL 于1.5mL EP管中,加入等体积4℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,-20℃静置15min。 (5)溶液4℃,10000g,10min离心,小心倒掉液体,加入1mL 4℃预冷的75%乙醇,颠倒数次,清洗RNA沉淀,4℃,10000g,5min离心,倒掉液体,于超净工作台中干燥数分钟,将乙醇充分挥发干净,加入10μL RNase-Free Water,充分溶解RNA。 2、第一链cDNA合成 第一链cDNA的合成采用PrimeScript™RT reagent Kit with gDNA Eraser进行(TaKaRa公司),主要步骤如下: (1)在冰上配置如下反应液,以除去基因组DNA。
![]() PCR仪上42℃ 2 min 4℃ (2)在冰上配置如下反应液
![]() PCR仪上37℃ 15 min 85℃ 5 sec 4℃ 3、荧光定量PCR 实时荧光定量PCR是在Life technologies公司的StepOne™ Real-Time PCR仪上完成,每个样品均作3个复孔,使用SYBR® Premix Ex Taq™试剂盒进行(TaKaRa公司): (1)反应程序为:预变性 95℃,1min 循环(40次) 95℃,15s→58℃,20s→72℃,45s 熔解曲线 60℃→95℃,每20s升温1℃ (2)反应体系为:
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引物名称 | 引物序列 | 产物长度(bp) | |
Forward | 5`--3` | ||
reverse | 5`--3` | ||
5`--3` | |||
5`--3` |
单位名称: |
详细地址:
湖北省武汉市洪山区中北路菩提金商务中心B座1825室(办事处)武汉市东湖新技术开发区高新二路388号武汉光谷国际生物医药企业加速器项目1.2期23#厂房
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