微量RNA甲基化测序
m6A 是一种常见的 RNA 甲基化修饰方式,研究表明它在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制 mRNA 寿命和降解、介导环状 RNA 翻译等方面扮演重要角色。伯豪生物新开发微量 MeRIP-seq 技术,利用新的去 rRNA 技术,可以同时检测 mRNA, lncRNA 及 circRNA 甲基化修饰图谱,帮助研究人员对 RNA 转录后甲基化修饰图谱进行研究,是表观转录组研究的关键技术。值得关注的是微量 MeRIP-seq 技术通过技术优化,大幅降低 MeRIP 的样本起始要求量,仅 1 -20μg 总 RNA 即可满足实验要求。
子宫内膜癌(英语:endometrial cancer),指的是源自子宫内膜的癌症。其病因是由于细胞异常的生长,并且具备了能够侵袭或扩散到身体其他部位的能力。目前的治疗以手术移除子宫为主。通常会一并进行双侧输卵管及卵巢切除术(Bilateral Salpingo-oophorectomy,BSO),移除双侧输卵管和卵巢。对于较为严重的个案,放射治疗、化疗和贺尔蒙疗法也需要列入考虑。早期发现并接受治疗的子宫内膜癌,未来预后会较好。在美国,病患的五年存活率超过八成。
为了研究 m 6 A mRNA 甲基化在细胞增殖和肿 瘤发生中的作用,作者研究了在甲基转移酶复合物(METTL14)存在 R298P 热点突变的子宫内膜癌。作者发现约 70% 的子宫内膜肿 瘤患者表现出 m 6 A 甲基化的减少,推测这可能是由于 METTL14 突变(m6A 的 writer)或 METTL3(m6A 的 writer)的表达降低所致。上述变化通过激活 AKT 途径导致子宫内膜癌细胞的增殖和肿 瘤发生机率增加。减少 m 6 A 甲基化导致降低 AKT 通路中的起负调控作用 PHLPP2 的表达和 AKT 通路正调节因子 mTORC2 的表达。总之,这些结果揭示了 m 6 A mRNA 甲基化减少是子宫内膜癌中的致癌机制,并确定了 m 6 A 甲基化可作为 AKT 信号传导的调节剂。
图 1 AKT 通路相关基因中肿 瘤组织相对正常组织 m6A 低甲基化
图 2 m6A 低甲基化介导 AKT 通路促进癌症发生的机制:m6A 甲基化通常通过促进 m6A 依赖的 PHLPP2 翻译和 m6A 依赖的 mTORC2 亚基转录本降解来减弱 AKT 通路活性。
PHLPP2 磷酸酶的上调和 mTORC2 激酶的下调均通过维持 AKT 的去磷酸化而抑制 AKT 活性。m6A 甲基化的减少破坏了这些转录本的调控,导致 PHLPP2 表达降低,mTORC2 表达增加,AKT 活性增加。
Guo J, Grow E J, Yi C, et al. Chromatin and single-cell RNA-seq profiling reveal dynamic signaling and metabolic transitions during human spermatogonial stem cell development[J]. Cell Stem Cell, 2017, 21(4): 533-546. e6.
上海伯豪生物技术有限公司(简称:伯豪生物,英文名:Shanghai Biotechnology Corporation)2008 年 12 月成立,是生物芯片国家工程研究中心的有机组成部分,专注于提供专业的生物医药和疾病诊断创新技术、产品和优质服务。
伯豪生物自成立以来获得了国家基因检测技术应用示范中心、国家工信部专精特新“小巨人”企业、院士专家工作站、高新技术企业、上海市研发公共服务平台(负责“上海市高通量疾病标志物服务平台”和“上海市基因芯片专业服务平台”的运营)、上海市服务外包公共平台、上海科技小巨人企业、浦东新区企业研发机构、联合实验室建设等一系列资质,拥有医疗机构执业许可证、医疗器械经营许可证。
伯豪生物于 2016 年入选国家发展和改革委员会首批基因检测技术应用示范中心,与复旦大学附属肿瘤医院、上海市胸科医院、上海市儿童医院、上海生物信息技术研究中心等单位共同承担运行“高发肿瘤及遗传性疾病基因检测示范中心”。
伯豪生物建立了规范化的质量控制体系,通过了 ISO9001:2015 质量技术体系的认证,并参照 GLP- L 的标准,通过 156 个 SOP 文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。
伯豪生物累计技术服务 10 余年,承接项目数超 10000 个,用户单位 3000 家以上,累计处理样品超过 30 万份,协助客户发表论文 2000 余篇,总影响因子(IF)超 10000 分,平均影响因子(IF)大于 5 分。全面推动中国基因组学服务产业发展。可靠的质量已经得到了国内及国际科研领域的认可!伯豪生物秉承着“服务科技创新,护航人类健康!”的使命,为每一位伯豪生物客户提供专注、专业、高效的科研技术服务。
伯豪生物经过十多年不断投入和持续打造,伯豪生物已经成长为一家硬件精良,人才合理,技术专业,管理规范,理念先进,符合国际标准的以技术开发和技术服务见长的生物技术公司。
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