分子与细胞

DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术服务

基本信息
服务名称:
DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术服务
英文名称:
参考报价:
总点击数:
284
更新日期:
2024-10-09
服务类别:

服务详情

在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而,好的抗体可遇不可求,这限制了ChIP-seq更广泛的应用。

DAP-seq技术的出现,使TFBS 的研究不再局限于物种,不再受抗体质量的限制,为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。

服务项目 周期 交付结果 报价
蛋白表达载体构建 1-2周

构建载体的测序结果

实验过程图

原始测序数据

分析结果

详细报价请电询400-6187099

或15632249798

蛋白无细胞表达 1-2周
DAP-seq文库构建 1周
DNA亲和纯化 1-2周
上机测序 2周
标准数据分析 2周

实验流程:


生信分析:
生信分析
  • 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理 

  • 数据产出统计

  • 参考序列比对分析  

  • 测序reads富集区域扫描(peak calling)

  • Peak在基因功能元件上的分布统计 

  • Peak序列模式发掘(motif search) 

  • 已知motif注释 

  • Peak相关基因鉴定

  • Peak相关基因的GO和KEGG富集分析 

  • 测序数据的可视化分析


蓝景科信为您提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析,具有100多个物种,2000多个转录因子的实战经验。欢迎咨询。
公司简介
技术服务:
1、DAP-seq:高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点。
2、酵母单杂交:研究蛋白质和特定DNA序列相互作用。
3、酵母双杂交:检测已知蛋白质之间的相互作用,鉴定与已知蛋白相互作用的未知蛋白。
4、EMSA:鉴定或验证DNA结合蛋白和DNA序列的相互作用。
5、ChIP-seq:高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点。
6、DAP-seq与RNA-seq联合分析: 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。
7、DNA-pull down:鉴定与DNA结合的蛋白。
欢迎企业和课题组洽谈合作,电话:15632249798(微信同号),QQ:2522026793

售后服务
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