芯片与生物信息学

10X单细胞免疫组库测序

基本信息
服务名称：
10X单细胞免疫组库测序
英文名称：
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服务商：
北京果壳生物科技有限公司
总点击数：
249
更新日期：
2024-03-22
服务类别：
芯片与生物信息学
服务详情
10x Genomics单细胞免疫组库测序又称10x单细胞V(D)J测序，一次性能够分离500~10000个单细胞，利用5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集，并可以同时测定同一细胞的TCR、B细胞免疫球蛋白和5’基因表达，获得单个T细胞TCR的α链和β链的配对序列信息，单个B细胞的重链和轻链免疫球蛋白（Ig）配对序列，以及基因表达等信息，揭示免疫细胞的复杂性，有助于在传染病、自身免疫性疾病、免疫疗法开发和癌症研究中获得切实可行的深入见解。

技术优势
  • 分析数百至数万个淋巴细胞，以检测罕见的全长V（D）J转录物和细胞类型亚群；
  • 同时测量来自相同单细胞的配对的TCRα/β和BCR重链/轻链信息和基因表达，精确的H链和L链的组合、α链和β链的组合，性价比更高；
  • 细胞通量高：500-10000个；
  • 使用直观的软件工具显示免疫库的克隆性，多样性和细胞环境，对应分析软件工具可视化：Cell Ranger Analysis Pipeline和Loupe V（D）J Cell Browser;
  • 单个细胞成本最低

技术路线

技术参数
  • 组织样本：0.2g新鲜组织，置于美天旎组织保存液中，2-8℃保存，48h以内运输
  • 细胞总量：5 x 105个
  • 活细胞浓度：＞400 cell/ul
  • 细胞大小：5um≤细胞直径≤30um
  • 细胞活性：活细胞比例85%以上
  • 测序细胞个数：1000-10000
  • 测序数据量：单细胞转录组文库：100k Reads/细胞（30M bp/细胞）；10x TCR或者BCR文库：10k Reads/细胞（3M bp/细胞）
  • 测序模式：Illumina Novaseq6000，PE150测序模式

部分结果展示
clonotype频率分布图

V-J paired丰度分布热图

V-J paired 频率Circos图

样本间Clonotypes数目比较韦恩图













 
公司简介

北京果壳生物科技有限公司， 专注多组学与分子检测技术的研究和应用。公司成立于2017年，创始团队深耕基因检测领域，历任著名科研机构和上市公司骨干岗位。
公司在北京设有分子研发中心，占地面积约1500㎡，搭载Illumina iScan、NovaSeq 6000、10x Genomics、MassARRAY、KASP等中、高通量检测平台，为科研客户提供多组学研究的综合性解决方案。2020年，公司在成都建立临床医学检验所，具备临床基因扩增检验资质，占地面积约5000㎡，为西南地区较大的实验基地之一。拥有大规模基因组信息检测、数据分析能力，标准的质量控制流程，能够有效支撑临床实践过程中的检测项目实施需求。
果壳生物的基因芯片平台处于业内领先地位。公司先后自主研发ASA-CHIA芯片和GUOKE 50K芯片，广泛应用于科研队列研究和遗传病筛查领域，大大降低了分子诊断技术在终端的使用成本，目前检测能力高达10000例样本/周。
果壳生物目前已累计服务全国300余家科研院所、三甲医院，完成50万余份样本的基因检测工作，与全球近20位分子诊断领域的顶尖科学和医学专家建立深度合作，横跨基础研究、出生缺陷防控、个体化基因检测等多个领域，致力于让领先的基因组学检测技术发挥更大的应用价值。

公司联系方式：

电话：4000079358/18310710859

地址：北京市昌平区回龙观镇生命园路8号院6号楼401室

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