芯片与生物信息学

935K 甲基化芯片

基本信息
服务名称:
935K 甲基化芯片
英文名称:
Illumina infinium Methylation EPIC BeadChip detection
参考报价:
总点击数:
90
更新日期:
2024-06-27
服务类别:

服务详情
935K 甲基化芯片
芯片描述
Illumina公司的Infinium MethylationEPIC BeadChip Kit,可在单核苷酸水平上定量检测基因组中的超过935,000个甲基化位点。可平行分析包括FFPE在内的多个样本,从而在最大限度地减少每个样本成本的同时实现高通量。

Infinium HD芯片技术能够使内容选择摆脱因甲基化DNA捕获方法的偏差而受到的相关限制。结果包括泛增强子和编码区域的甲基化组图谱,可用于各种人类组织的表观基因组关联研究。



全面的全基因组覆盖度
该芯片包含甲基化专家要求的以下内容类别:

 
  • CpG岛以外的CpG位点
  • 人类干细胞中鉴定出的非CpG甲基化位点(CHH位点)
  • 肿瘤与正常样本中鉴定出的差异甲基化位点
  • FANTOM5增强子
  • ENCODE开放染色质和增强子
  • DNase超敏位点
  • miRNA启动子区域



整合的分析软件
MethylationEPIC数据分析由GenomeStudio Methylation Module提供支持。GenomeStudio软件可让研究人员轻松为小规模研究进行差异甲基化分析。它特有的高级视图工具,让研究人员能够在单幅图(如热图、散点图和线条图)中查看大量的数据。


这些工具以及GenomeStudio Genome Browser展示了大量有用信息,如染色体坐标、GC百分比、CpG岛的位置,以及甲基化β值。


对于大规模研究而言,现在有许多能在软件框架R语言下运行的免费分析包可供采用,可用于甲基化数据的归一化和差异分析。
公司简介
上海逆耳生物科技有限公司专注单细胞领域和生物空间组学领域的前沿技术服务,依托样本制备、单细胞处理、高通量测序、生物芯片检测和生物信息等技术平台,为客户提供融科技服务、项目转化、产品研发于一体的整体解决方案。

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